RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 PLXNB2O15031 1838 aa21.53■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 PRDM1O75626 825 aa21.53■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 GJB1P08034 283 aa21.53■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 ATP2B2Q01814 1243 aa21.53■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 COG2Q14746 738 aa21.53■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 GPR142Q7Z601 462 aa21.53■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 SNX14Q9Y5W7 946 aa21.53■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 PPARAQ07869 468 aa21.52■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 SOCS4Q8WXH5 440 aa21.52■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 USP6NLQ92738 828 aa21.52■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 KIF2CQ99661 725 aa21.52■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 NUDT12Q9BQG2 462 aa21.52■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 NBPF3Q9H094 633 aa21.52■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 HOXC10Q9NYD6 342 aa21.52■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 TAF6LQ9Y6J9 622 aa21.52■■□□□ 1.04
PTX4-201ENST00000293922 RLFQ13129 1914 aa21.51■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa21.51■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 WDR46O15213 610 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 GJA8P48165 433 aa21.51■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 HAND2P61296 217 aa21.51■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 CCNA1P78396 465 aa21.51■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 MORN1Q5T089 497 aa21.51■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 PLEKHH3Q7Z736 793 aa21.51■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 ZNF287Q9HBT7 754 aa21.51■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.51■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 HMGCRP04035 888 aa21.5■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 CYP2B6P20813 491 aa21.5■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 DSG3P32926 999 aa21.5■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 KRT32Q14532 448 aa21.5■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 NKX2-3Q8TAU0 364 aa21.5■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 NYAP2Q9P242 653 aa21.5■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 LAMA4Q16363 1823 aa21.5■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 FLOT1O75955 427 aa21.49■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 TRIM32Q13049 653 aa21.49■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 TBC1D10CQ8IV04 446 aa21.49■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 TRIB2Q92519 343 aa21.49■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 GOPCQ9HD26 462 aa21.49■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 A0A0G2JMZ2 1700 aa21.49■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 E7EWF7 191 aa21.48■■□□□ 1.03
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PTX4-201ENST00000293922 STOX1Q6ZVD7 989 aa21.48■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 STAG1Q8WVM7 1258 aa21.48■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 ATG4CQ96DT6 458 aa21.48■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 PLIN4Q96Q06 1357 aa21.48■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 PCP11498 1178 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 AKNAD1Q5T1N1 836 aa21.47■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 MB21D1Q8N884 522 aa21.47■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 CEP95Q96GE4 821 aa21.47■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 TM6SF1Q9BZW5 370 aa21.47■■□□□ 1.03
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PTX4-201ENST00000293922 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
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PTX4-201ENST00000293922 CTDSPL2Q05D32 466 aa21.46■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 ADCK5Q3MIX3 580 aa21.46■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 WDR78Q5VTH9 848 aa21.46■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 NEDD1Q8NHV4 660 aa21.46■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 MTMR4Q9NYA4 1195 aa21.46■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 CLIP2Q9UDT6 1046 aa21.46■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 SLC15A5A6NIM6 579 aa21.46■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 RAD21O60216 631 aa21.46■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 PTPREP23469 700 aa21.46■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 MAP2K5Q13163 448 aa21.46■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 FAM47AQ5JRC9 791 aa21.46■■□□□ 1.03
PTX4-201ENST00000293922 FAM83BQ5T0W9 1011 aa21.46■■□□□ 1.03
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PTX4-201ENST00000293922 DEFB118Q96PH6 123 aa21.46■■□□□ 1.03
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PTX4-201ENST00000293922 TACC3Q9Y6A5 838 aa21.46■■□□□ 1.03
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PTX4-201ENST00000293922 TSPY8P0CW00 308 aa21.45■■□□□ 1.02
PTX4-201ENST00000293922 PSMA5P28066 241 aa21.45■■□□□ 1.02
PTX4-201ENST00000293922 TFAP4Q01664 338 aa21.45■■□□□ 1.02
PTX4-201ENST00000293922 KLRC3Q07444 240 aa21.45■■□□□ 1.02
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PTX4-201ENST00000293922 PARP14Q460N5 1801 aa21.45■■□□□ 1.02
PTX4-201ENST00000293922 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa21.45■■□□□ 1.02
PTX4-201ENST00000293922 MFSD6Q6ZSS7 791 aa21.45■■□□□ 1.02
PTX4-201ENST00000293922 RPTORQ8N122 1335 aa21.45■■□□□ 1.02
PTX4-201ENST00000293922 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PTX4-201ENST00000293922 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PTX4-201ENST00000293922 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
PTX4-201ENST00000293922 INCENPQ9NQS7 918 aa21.45■■□□□ 1.02
PTX4-201ENST00000293922 TTLL1O95922 423 aa21.44■■□□□ 1.02
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