RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233331.11

INO80B-201, Transcript of INO80 complex subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene INO80B, Length 1,261 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80B-201ENST00000233331 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP36.32■■■■□ 3.4
INO80B-201ENST00000233331 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa36.32■■■■□ 3.4
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INO80B-201ENST00000233331 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa36.31■■■■□ 3.4
INO80B-201ENST00000233331 CCL5P13501 91 aa36.3■■■■□ 3.4
INO80B-201ENST00000233331 PLS1Q14651 629 aa36.3■■■■□ 3.4
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INO80B-201ENST00000233331 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa36.3■■■■□ 3.4
INO80B-201ENST00000233331 STX8Q9UNK0 236 aa36.3■■■■□ 3.4
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INO80B-201ENST00000233331 DSCC1Q9BVC3 393 aa36.29■■■■□ 3.4
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INO80B-201ENST00000233331 IL17RBQ9NRM6 502 aa36.28■■■■□ 3.4
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INO80B-201ENST00000233331 RAD50Q92878 1312 aa36.28■■■■□ 3.4
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INO80B-201ENST00000233331 STAG1Q8WVM7 1258 aa36.27■■■■□ 3.4
INO80B-201ENST00000233331 SLF1Q9BQI6 1058 aa36.27■■■■□ 3.4
INO80B-201ENST00000233331 RNF208Q9H0X6 261 aa36.27■■■■□ 3.4
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INO80B-201ENST00000233331 TRIB2Q92519 343 aa36.25■■■■□ 3.39
INO80B-201ENST00000233331 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa36.25■■■■□ 3.39
INO80B-201ENST00000233331 VWA5AO00534 786 aa36.24■■■■□ 3.39
INO80B-201ENST00000233331 ERCC3P19447 782 aa36.24■■■■□ 3.39
INO80B-201ENST00000233331 APBA2Q99767 749 aa36.24■■■■□ 3.39
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INO80B-201ENST00000233331 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
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INO80B-201ENST00000233331 FEM1BQ9UK73 627 aa36.2■■■■□ 3.39
INO80B-201ENST00000233331 NEFLP07196 543 aa36.19■■■■□ 3.38
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INO80B-201ENST00000233331 NKX2-3Q8TAU0 364 aa36.19■■■■□ 3.38
INO80B-201ENST00000233331 ESR2Q92731 530 aa36.19■■■■□ 3.38
INO80B-201ENST00000233331 KIFC2Q96AC6 838 aa36.19■■■■□ 3.38
INO80B-201ENST00000233331 GMCL1Q96IK5 515 aa36.19■■■■□ 3.38
INO80B-201ENST00000233331 CCDC136Q96JN2 1154 aa36.19■■■■□ 3.38
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INO80B-201ENST00000233331 SLC25A27O95847 323 aa36.18■■■■□ 3.38
INO80B-201ENST00000233331 SLC1A4P43007 532 aa36.18■■■■□ 3.38
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INO80B-201ENST00000233331 ZNF236Q9UL36 1845 aa36.18■■■■□ 3.38
INO80B-201ENST00000233331 MCCP23508 829 aa36.17■■■■□ 3.38
INO80B-201ENST00000233331 STAT3P40763 770 aa36.17■■■■□ 3.38
INO80B-201ENST00000233331 GJA8P48165 433 aa36.17■■■■□ 3.38
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INO80B-201ENST00000233331 SHISA4Q96DD7 197 aa36.17■■■■□ 3.38
INO80B-201ENST00000233331 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
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INO80B-201ENST00000233331 STRNO43815 780 aa36.16■■■■□ 3.38
INO80B-201ENST00000233331 ADORA2AP29274 412 aa36.16■■■■□ 3.38
INO80B-201ENST00000233331 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
INO80B-201ENST00000233331 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP36.16■■■■□ 3.38
INO80B-201ENST00000233331 SGSM2O43147 1006 aa36.15■■■■□ 3.38
INO80B-201ENST00000233331 ZBED4O75132 1171 aa36.15■■■■□ 3.38
INO80B-201ENST00000233331 RASGRP2Q7LDG7 609 aa36.15■■■■□ 3.38
INO80B-201ENST00000233331 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
INO80B-201ENST00000233331 TOP1P11387 765 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
INO80B-201ENST00000233331 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
INO80B-201ENST00000233331 STAT2P52630 851 aa36.14■■■■□ 3.38
INO80B-201ENST00000233331 IKQ13123 557 aaPredicted RBP36.14■■■■□ 3.38
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