RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592052.1

TMEM259-208, Transcript of transmembrane protein 259, human

Gene TMEM259, Length 1,637 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM259-208	ENST00000592052	GOPC	Q9HD26	462 aa		29.12	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	MAP2K2	P36507	400 aa		29.11	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	29.11	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	SREBF2	Q12772	1141 aa		29.11	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		29.11	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	ANKS1A	Q92625	1134 aa		29.11	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	TMEM87B	Q96K49	555 aa		29.11	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	ZIC5	Q96T25	663 aa		29.11	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	29.1	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	29.1	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		29.1	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	29.1	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		29.1	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	VCPKMT	Q9H867	229 aa		29.1	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		29.1	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		29.1	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		29.1	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	RPS6KB1	P23443	525 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	WTAP	Q15007	396 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	SEC23A	Q15436	765 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	RAD21	O60216	631 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	CPA1	P15085	419 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	RUFY3	Q7L099	469 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	LPAR1	Q92633	364 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	C12orf42	Q96LP6	360 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	KAT14	Q9H8E8	782 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	DGKZ	Q13574	1117 aa		29.08	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	MOGS	Q13724	837 aa		29.08	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		29.08	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		29.08	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052		F5H6K3	240 aa		29.07	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	KLRC3	Q07444	240 aa		29.07	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		29.07	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		29.07	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		29.07	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	TM4SF4	P48230	202 aa		29.06	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	FGD1	P98174	961 aa		29.06	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		29.06	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	TMTC2	Q8N394	836 aa		29.06	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	LY9	Q9HBG7	655 aa		29.06	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	PTPRF	P10586	1907 aa		29.06	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	MYH4	Q9Y623	1939 aa		29.06	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	PNMA1	Q8ND90	353 aa		29.05	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		29.05	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	NDUFB10	O96000	172 aa		29.05	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	VCAM1	P19320	739 aa		29.05	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	LIFR	P42702	1097 aa		29.05	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		29.05	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	PTPN18	Q99952	460 aa		29.05	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	29.05	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	CEP350	Q5VT06	3117 aa		29.04	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	TREML2	Q5T2D2	321 aa		29.04	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	SLFN13	Q68D06	897 aa		29.04	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		29.04	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		29.04	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		29.03	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		29.03	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	BTBD19	C9JJ37	291 aa		29.03	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		29.03	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		29.03	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	IFNL1	Q8IU54	200 aa		29.03	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	SENP2	Q9HC62	589 aa		29.03	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	29.02	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052		Q6ZUG5	572 aa		29.02	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	MTMR7	Q9Y216	660 aa		29.02	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	CCDC69	A6NI79	296 aa		29.02	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	29.02	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		29.02	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	FBXL16	Q8N461	479 aa		29.02	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	GMCL1	Q96IK5	515 aa		29.02	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	KIF2C	Q99661	725 aa		29.02	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	29.02	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		29.02	■■■□□ 2.24
TMEM259-208	ENST00000592052	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		29.01	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	29.01	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		29.01	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	PDHX	O00330	501 aa		29	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	29	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	SLC1A4	P43007	532 aa		29	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		29	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	DCAF4	Q8WV16	495 aa		29	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	USP17L15	C9J2P7	530 aa		28.99	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		28.99	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	USP17L11	C9JVI0	530 aa		28.99	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	USP17L18	D6R9N7	530 aa		28.99	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	USP17L22	D6RA61	530 aa		28.99	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		28.99	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	USP17L19	D6RCP7	530 aa		28.99	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	USP17L20	D6RJB6	530 aa		28.99	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	USP17L24	Q0WX57	530 aa		28.99	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		28.99	■■■□□ 2.23
TMEM259-208	ENST00000592052	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		28.99	■■■□□ 2.23

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