RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590367.5

EFTUD2-218, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 3,638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-218ENST00000590367 KIF5CO60282 957 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 MYL6BP14649 208 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 GJA8P48165 433 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 RIC3Q7Z5B4 369 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 TBC1D5Q92609 795 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 LTN1O94822 1766 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 LRRD1A4D1F6 860 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 RHOXF2BP0C7M4 288 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 GNAT1P11488 350 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 KCNA4P22459 653 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 SESN3P58005 492 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 TRAPPC3LQ5T215 181 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC70Q6NSX1 233 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 MTHFD1LQ6UB35 978 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC80Q76M96 950 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 KIAA0825Q8IV33 1275 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 TTC5Q8N0Z6 440 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 RHOXF2Q9BQY4 288 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 PAGR1Q9BTK6 254 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 IFNKQ9P0W0 207 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 ZEB2O60315 1214 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 UNC45AQ9H3U1 944 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 TMEM165Q9HC07 324 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 CEP104O60308 925 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 E2F6O75461 281 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 SASH1O94885 1247 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 PDHBP11177 359 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 NSMCE1Q8WV22 266 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 FMNL2Q96PY5 1086 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 SIL1Q9H173 461 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 RASSF10A6NK89 507 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 DDX58O95786 925 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 SYF2O95926 243 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 USP4Q13107 963 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 WDR93Q6P2C0 686 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 GALNT15Q8N3T1 639 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 ABCC6O95255 1503 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 ERVV-2B6SEH9 535 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 VSNL1P62760 191 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 NEXNQ0ZGT2 675 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 ITPK1Q13572 414 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 FUKQ8N0W3 1084 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 LINC00116Q8NCU8 138 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 P3H4Q92791 437 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 IL17RAQ96F46 866 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 GPATCH3Q96I76 525 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 USP44Q9H0E7 712 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 VWA3AA6NCI4 1184 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 RNF8O76064 485 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 MYO1EQ12965 1108 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 GNPTABQ3T906 1256 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 TEX9Q8N6V9 391 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 NLGN2Q8NFZ4 835 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 RASSF8Q8NHQ8 419 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 PNKPQ96T60 521 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 TOP1P11387 765 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 MXRA7P84157 204 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 AKAP4Q5JQC9 854 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 RHPN1Q8TCX5 695 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 CUL5Q93034 780 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 CFAP45Q9UL16 551 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 HPCAL4Q9UM19 191 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 C15orf41Q9Y2V0 281 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 CTAGE9A4FU28 777 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 B4DLN1 442 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 VCAM1P19320 739 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 SPECC1Q5M775 1068 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 SEPT14Q6ZU15 432 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 CNTROBQ8N137 903 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-218ENST00000590367 COG1Q8WTW3 980 aa8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.9 ms