RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 GGA1Q9UJY5 639 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 ARAP3Q8WWN8 1544 aa5.49□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 IQCA1LA6NCM1 817 aa5.49□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM86C2PA6NEL3 165 aa5.49□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 PDE8AO60658 829 aa5.49□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 ALBP02768 609 aa5.49□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 PLCG1P19174 1290 aa5.49□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
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CAPNS1-210ENST00000590211 GSTM4Q03013 218 aa5.49□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 RING1Q06587 406 aa5.49□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 TXNDC11Q6PKC3 985 aa5.49□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 CYFIP1Q7L576 1253 aa5.49□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 IL22RA1Q8N6P7 574 aa5.49□□□□□ -1.53
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CAPNS1-210ENST00000590211 EXOC2Q96KP1 924 aa5.49□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 KIF2CQ99661 725 aa5.49□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 MYH16Q9H6N6 1097 aa5.49□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
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CAPNS1-210ENST00000590211 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa5.49□□□□□ -1.53
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CAPNS1-210ENST00000590211 KIF15Q9NS87 1388 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 GSG1L2A8MUP6 293 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 ALG1L2C9J202 215 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 LINC01387J3KSC0 135 aa5.48□□□□□ -1.53
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CAPNS1-210ENST00000590211 RAPGEF3O95398 923 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 TSPY4P0CV99 314 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 TSPY10P0CW01 314 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 EPXP11678 715 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 PMLP29590 882 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 CDC25BP30305 580 aa5.48□□□□□ -1.53
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CAPNS1-210ENST00000590211 MAP2K3P46734 347 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 CABP4P57796 275 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 PIP4K2BP78356 416 aa5.48□□□□□ -1.53
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CAPNS1-210ENST00000590211 C19orf57Q0VDD7 668 aa5.48□□□□□ -1.53
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CAPNS1-210ENST00000590211 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 RNFT1Q5M7Z0 435 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM201Q5SNT2 666 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 HDXQ7Z353 690 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC146Q8IYE0 955 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 ACSBG1Q96GR2 724 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 C8orf48Q96LL4 319 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 CLUHP3Q96NS8 147 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
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CAPNS1-210ENST00000590211 IQGAP3Q86VI3 1631 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa5.48□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1W2PQU0 124 aa5.47□□□□□ -1.53
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CAPNS1-210ENST00000590211 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
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CAPNS1-210ENST00000590211 PLD2O14939 933 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 PRC1O43663 620 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 ALDH1L1O75891 902 aa5.47□□□□□ -1.53
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CAPNS1-210ENST00000590211 VSIG8P0DPA2 414 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 MAOBP27338 520 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 SETDB1Q15047 1291 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 POU4F3Q15319 338 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 AKAP4Q5JQC9 854 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM209AQ5JX71 171 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 GORABQ5T7V8 394 aa5.47□□□□□ -1.53
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CAPNS1-210ENST00000590211 GALNT11Q8NCW6 608 aa5.47□□□□□ -1.53
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CAPNS1-210ENST00000590211 DHRS4Q9BTZ2 278 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 MCM8Q9UJA3 840 aa5.47□□□□□ -1.53
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CAPNS1-210ENST00000590211 ABCA9Q8IUA7 1624 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 DUOX2Q9NRD8 1548 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM135AQ9P2D6 1515 aa5.47□□□□□ -1.53
CAPNS1-210ENST00000590211 ADAM11O75078 769 aa5.46□□□□□ -1.54
CAPNS1-210ENST00000590211 CYP11A1P05108 521 aa5.46□□□□□ -1.54
CAPNS1-210ENST00000590211 LIG1P18858 919 aa5.46□□□□□ -1.54
CAPNS1-210ENST00000590211 CCNFP41002 786 aa5.46□□□□□ -1.54
CAPNS1-210ENST00000590211 KRT76Q01546 638 aa5.46□□□□□ -1.54
CAPNS1-210ENST00000590211 PDE4BQ07343 736 aa5.46□□□□□ -1.54
CAPNS1-210ENST00000590211 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
CAPNS1-210ENST00000590211 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CAPNS1-210ENST00000590211 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
CAPNS1-210ENST00000590211 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
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