RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 CASP8Q14790 479 aa8.71□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF569Q5MCW4 686 aa8.71□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 TTLL7Q6ZT98 887 aa8.71□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 SRLQ86TD4 932 aa8.71□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 AMOTL1Q8IY63 956 aa8.71□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF654Q8IZM8 581 aa8.71□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 SPATA5Q8NB90 893 aa8.71□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 OR8K1Q8NGG5 319 aa8.71□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 PHF20Q9BVI0 1012 aa8.71□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 ZBTB3Q9H5J0 574 aa8.71□□□□□ -1.02
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CAPNS1-202ENST00000586851 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 ZSWIM5Q9P217 1185 aa8.71□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 RNF14Q9UBS8 474 aa8.71□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 TSKSQ9UJT2 592 aa8.71□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 MYH13Q9UKX3 1938 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1W2PQJ5 194 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 PSMA7O14818 248 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 OPA1O60313 960 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 DTNBO60941 627 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 SASH3O75995 380 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 FGFR2P21802 821 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 ITGA6P23229 1130 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 ADORA1P30542 326 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 KIF5BP33176 963 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 GNAQP50148 359 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 ADKP55263 362 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 PDE4BQ07343 736 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 RBL2Q08999 1139 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 PARP10Q53GL7 1025 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 COBLL1Q53SF7 1204 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 TTLL11Q8NHH1 800 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 AFAP1L1Q8TED9 768 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 PHKBQ93100 1093 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 PAGE5Q96GU1 130 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 CLIC6Q96NY7 704 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 DNAJC7Q99615 494 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 CRACR2AQ9BSW2 395 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 BRIP1Q9BX63 1249 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 EDEM3Q9BZQ6 932 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 CSRNP2Q9H175 543 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 YY1AP1Q9H869 796 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 TMOD3Q9NYL9 352 aa8.7□□□□□ -1.02
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CAPNS1-202ENST00000586851 SAR1BQ9Y6B6 198 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 MAST2Q6P0Q8 1798 aa8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A087WWV3 80 aa8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 LGALS16A8MUM7 142 aa8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 MYO1CO00159 1063 aa8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 USO1O60763 962 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 NDUFA10O95299 355 aa8.69□□□□□ -1.02
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CAPNS1-202ENST00000586851 FGRP09769 529 aa8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 TNFRSF8P28908 595 aa8.69□□□□□ -1.02
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CAPNS1-202ENST00000586851 USP14P54578 494 aa8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 AMPD2Q01433 879 aa8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 PPFIA1Q13136 1202 aa8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 NNTQ13423 1086 aa8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 TCP11X2Q5H9J9 407 aa8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 TTC38Q5R3I4 469 aa8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 WWC2Q6AWC2 1192 aa8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 RAD9BQ6WBX8 426 aa8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 NLRP10Q86W26 655 aa8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 CERS3Q8IU89 383 aa8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 TRIM58Q8NG06 486 aa8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 AK8Q96MA6 479 aa8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 LZTFL1Q9NQ48 299 aa8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 VPS18Q9P253 973 aa8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 CAPN11Q9UMQ6 739 aa8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
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