RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568388.5

SPNS1-210, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 759 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-210ENST00000568388 PPP2R5BQ15173 497 aa21.89■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 CLEC10AQ8IUN9 316 aa21.89■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 CHMP4CQ96CF2 233 aa21.89■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 HPS5Q9UPZ3 1129 aa21.89■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 TMX2Q9Y320 296 aa21.89■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 CSADQ9Y600 493 aa21.89■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa21.89■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 CELF2O95319 508 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 LARGE1O95461 756 aa21.88■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 CUL4AQ13619 759 aa21.88■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 VGLL4Q14135 290 aa21.88■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 C2orf69Q8N8R5 385 aa21.88■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 AS3MTQ9HBK9 375 aa21.88■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 A0A1W2PRG0 241 aa21.87■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 CST9Q5W186 159 aa21.87■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 MOB2Q70IA6 237 aa21.87■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 SH2D4AQ9H788 454 aa21.87■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF408Q9H9D4 720 aa21.87■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 RASSF10A6NK89 507 aa21.86■■□□□ 1.09
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SPNS1-210ENST00000568388 ATP2B2Q01814 1243 aa21.86■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 IFFO2Q5TF58 517 aa21.86■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 FANCBQ8NB91 859 aa21.86■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa21.86■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 ACER1Q8TDN7 264 aa21.86■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 GTF3C6Q969F1 213 aa21.86■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 THSD7BQ9C0I4 1608 aa21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 PTPRFP10586 1907 aa21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 SNHG28P0DPA3 235 aa21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 VEGFBP49765 207 aa21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.09
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SPNS1-210ENST00000568388 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa21.84■■□□□ 1.09
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SPNS1-210ENST00000568388 F5H6K3 240 aa21.84■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 ECE1P42892 770 aa21.84■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 PPATQ06203 517 aa21.84■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 KLRC3Q07444 240 aa21.84■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 SCRN1Q12765 414 aa21.84■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 STK3Q13188 491 aa21.84■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 GRM4Q14833 912 aa21.84■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 MICU3Q86XE3 530 aa21.84■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF280CQ8ND82 737 aa21.84■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 NUP133Q8WUM0 1156 aa21.84■■□□□ 1.09
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SPNS1-210ENST00000568388 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
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SPNS1-210ENST00000568388 C19orf81C9J6K1 198 aa21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 USP17L10C9JJH3 530 aa21.83■■□□□ 1.09
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SPNS1-210ENST00000568388 PDHBP11177 359 aa21.83■■□□□ 1.09
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SPNS1-210ENST00000568388 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
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SPNS1-210ENST00000568388 VCPKMTQ9H867 229 aa21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-210ENST00000568388 GOPCQ9HD26 462 aa21.83■■□□□ 1.09
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SPNS1-210ENST00000568388 USP14P54578 494 aa21.82■■□□□ 1.08
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SPNS1-210ENST00000568388 SLFN13Q68D06 897 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS1-210ENST00000568388 CCDC83Q8IWF9 413 aa21.82■■□□□ 1.08
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SPNS1-210ENST00000568388 GMCL1Q96IK5 515 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS1-210ENST00000568388 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
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SPNS1-210ENST00000568388 RXRAP19793 462 aa21.81■■□□□ 1.08
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SPNS1-210ENST00000568388 BACE1P56817 501 aa21.81■■□□□ 1.08
SPNS1-210ENST00000568388 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
SPNS1-210ENST00000568388 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa21.81■■□□□ 1.08
SPNS1-210ENST00000568388 SLC10A4Q96EP9 437 aa21.81■■□□□ 1.08
SPNS1-210ENST00000568388 MAD2L2Q9UI95 211 aa21.81■■□□□ 1.08
SPNS1-210ENST00000568388 MYH6P13533 1939 aa21.8■■□□□ 1.08
SPNS1-210ENST00000568388 CXCL11O14625 94 aa21.8■■□□□ 1.08
SPNS1-210ENST00000568388 NDUFB10O96000 172 aa21.8■■□□□ 1.08
SPNS1-210ENST00000568388 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SPNS1-210ENST00000568388 SMARCA1P28370 1054 aa21.8■■□□□ 1.08
SPNS1-210ENST00000568388 PPIL2Q13356 520 aa21.8■■□□□ 1.08
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