RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 C16orf59Q7L2K0 433 aa16.83■□□□□ 0.28
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CS-231ENST00000552222 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP16.83■□□□□ 0.284e-7■■□□□ 13.5
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CS-231ENST00000552222 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
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CS-231ENST00000552222 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
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CS-231ENST00000552222 USP17L20D6RJB6 530 aa16.82■□□□□ 0.28
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CS-231ENST00000552222 LDHCP07864 332 aa16.81■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 ACRP10323 421 aa16.81■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 CCNA1P78396 465 aa16.81■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 FPGSQ05932 587 aa16.81■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 TMEM39AQ9NV64 488 aa16.81■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 KIAA0355O15063 1070 aa16.8■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 KCNQ1P51787 676 aa16.8■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 GSTO1P78417 241 aa16.8■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 FAAP100Q0VG06 881 aa16.8■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 RAB3GAP1Q15042 981 aa16.8■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa16.8■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 LRP2BPQ9P2M1 347 aa16.8■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 TACC3Q9Y6A5 838 aa16.8■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 REV3LO60673 3130 aa16.79■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 SURF6O75683 361 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
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CS-231ENST00000552222 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP16.79■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa16.79■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
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CS-231ENST00000552222 PHF24Q9UPV7 400 aa16.79■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa16.79■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 A0A1W2PQY0 241 aa16.78■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP16.78■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 XIRP2A4UGR9 3374 aa16.78■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 CHD9Q3L8U1 2897 aa16.77■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 BMP1P13497 986 aa16.77■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 GUCY1A2P33402 732 aa16.77■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 C1orf53Q5VUE5 145 aa16.77■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 OLFML2BQ68BL8 750 aa16.77■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 LRFN3Q9BTN0 628 aa16.77■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa16.77■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa16.77■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa16.77■□□□□ 0.28
CS-231ENST00000552222 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
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CS-231ENST00000552222 MYADML2A6NDP7 307 aa16.76■□□□□ 0.27
CS-231ENST00000552222 FAM86C2PA6NEL3 165 aa16.76■□□□□ 0.27
CS-231ENST00000552222 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa16.76■□□□□ 0.27
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CS-231ENST00000552222 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa16.76■□□□□ 0.27
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CS-231ENST00000552222 MYOGP15173 224 aa16.75■□□□□ 0.27
CS-231ENST00000552222 CSF2RAP15509 400 aa16.75■□□□□ 0.27
CS-231ENST00000552222 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
CS-231ENST00000552222 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
CS-231ENST00000552222 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
CS-231ENST00000552222 PLS1Q14651 629 aa16.75■□□□□ 0.27
CS-231ENST00000552222 AKNAD1Q5T1N1 836 aa16.75■□□□□ 0.27
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