RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496465.1

TM2D1-211, Transcript of TM2 domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TM2D1, Length 577 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D1-211ENST00000496465 TFRCP02786 760 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
TM2D1-211ENST00000496465 ICA1Q05084 483 aa21.85■■□□□ 1.09
TM2D1-211ENST00000496465 TRIM32Q13049 653 aa21.85■■□□□ 1.09
TM2D1-211ENST00000496465 COG2Q14746 738 aa21.85■■□□□ 1.09
TM2D1-211ENST00000496465 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa21.85■■□□□ 1.09
TM2D1-211ENST00000496465 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa21.85■■□□□ 1.09
TM2D1-211ENST00000496465 CRBNQ96SW2 442 aa21.85■■□□□ 1.09
TM2D1-211ENST00000496465 SH2D4AQ9H788 454 aa21.85■■□□□ 1.09
TM2D1-211ENST00000496465 HOXC10Q9NYD6 342 aa21.85■■□□□ 1.09
TM2D1-211ENST00000496465 BTBD7Q9P203 1132 aa21.85■■□□□ 1.09
TM2D1-211ENST00000496465 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
TM2D1-211ENST00000496465 RGS2P41220 211 aa21.84■■□□□ 1.09
TM2D1-211ENST00000496465 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
TM2D1-211ENST00000496465 CLEC10AQ8IUN9 316 aa21.84■■□□□ 1.09
TM2D1-211ENST00000496465 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
TM2D1-211ENST00000496465 HTATIP2Q9BUP3 242 aa21.84■■□□□ 1.09
TM2D1-211ENST00000496465 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
TM2D1-211ENST00000496465 GPAA1O43292 621 aa21.83■■□□□ 1.09
TM2D1-211ENST00000496465 GNAT2P19087 354 aa21.83■■□□□ 1.09
TM2D1-211ENST00000496465 TANGO6Q9C0B7 1094 aa21.83■■□□□ 1.09
TM2D1-211ENST00000496465 VCPKMTQ9H867 229 aa21.83■■□□□ 1.09
TM2D1-211ENST00000496465 KANSL2Q9H9L4 492 aa21.83■■□□□ 1.09
TM2D1-211ENST00000496465 ROBO3Q96MS0 1386 aa21.83■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 SALL3Q9BXA9 1300 aa21.82■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 MX1P20591 662 aa21.82■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 MAP2K5Q13163 448 aa21.82■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 DPF3Q92784 378 aa21.82■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 APBA2Q99767 749 aa21.82■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 ZNF236Q9UL36 1845 aa21.82■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 ALPK3Q96L96 1907 aa21.82■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 SLC15A5A6NIM6 579 aa21.81■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 H0YGN5 161 aa21.81■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 M0R2C6 588 aa21.81■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 EEF2P13639 858 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 PTPREP23469 700 aa21.81■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 ANKLE1Q8NAG6 615 aa21.81■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 MYH4Q9Y623 1939 aa21.8■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 WDR46O15213 610 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 DSG3P32926 999 aa21.8■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 SPICE1Q8N0Z3 855 aa21.8■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 MB21D1Q8N884 522 aa21.8■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.8■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 FRMPD3Q5JV73 1810 aa21.79■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 HOXC6P09630 235 aa21.79■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 RASA1P20936 1047 aa21.79■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 AAMPQ13685 434 aa21.79■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 GRB14Q14449 540 aa21.79■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 CCL14Q16627 93 aa21.79■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa21.79■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 MINDY4BA8MYZ0 360 aa21.78■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 FLOT1O75955 427 aa21.78■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 ANKRD45Q5TZF3 282 aa21.78■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 WDR78Q5VTH9 848 aa21.78■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 SHCBP1Q8NEM2 672 aa21.78■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 FSD1Q9BTV5 496 aa21.78■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 SPATC1LQ9H0A9 340 aa21.78■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 MKNK2Q9HBH9 465 aa21.78■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 STAP2Q9UGK3 403 aa21.78■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 OGDHLQ9ULD0 1010 aa21.78■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 STRNO43815 780 aa21.77■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 TDO2P48775 406 aa21.77■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa21.77■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.77■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 GOPCQ9HD26 462 aa21.77■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa21.77■■□□□ 1.08
TM2D1-211ENST00000496465 APPP05067 770 aa21.76■■□□□ 1.07
TM2D1-211ENST00000496465 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
TM2D1-211ENST00000496465 ATP2B2Q01814 1243 aa21.76■■□□□ 1.07
TM2D1-211ENST00000496465 NECAB2Q7Z6G3 386 aa21.76■■□□□ 1.07
TM2D1-211ENST00000496465 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
TM2D1-211ENST00000496465 ATG4CQ96DT6 458 aa21.76■■□□□ 1.07
TM2D1-211ENST00000496465 ZNF287Q9HBT7 754 aa21.76■■□□□ 1.07
TM2D1-211ENST00000496465 FLRT1Q9NZU1 646 aa21.76■■□□□ 1.07
TM2D1-211ENST00000496465 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
TM2D1-211ENST00000496465 IGHA2P01877 340 aa21.75■■□□□ 1.07
TM2D1-211ENST00000496465 NACAP1Q9BZK3 213 aa21.75■■□□□ 1.07
TM2D1-211ENST00000496465 NYAP2Q9P242 653 aa21.75■■□□□ 1.07
TM2D1-211ENST00000496465 NR2E3Q9Y5X4 410 aa21.75■■□□□ 1.07
TM2D1-211ENST00000496465 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa21.75■■□□□ 1.07
TM2D1-211ENST00000496465 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa21.74■■□□□ 1.07
TM2D1-211ENST00000496465 ERCC3P19447 782 aa21.74■■□□□ 1.07
TM2D1-211ENST00000496465 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
TM2D1-211ENST00000496465 MFSD14CQ5VZR4 134 aa21.74■■□□□ 1.07
TM2D1-211ENST00000496465 LHX8Q68G74 356 aa21.74■■□□□ 1.07
TM2D1-211ENST00000496465 STK11IPQ8N1F8 1099 aa21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms