RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
ACTB-209ENST00000473257 TANGO6Q9C0B7 1094 aa13.6□□□□□ -0.23
ACTB-209ENST00000473257 FRMPD3Q5JV73 1810 aa13.6□□□□□ -0.23
ACTB-209ENST00000473257 DLL1O00548 723 aa13.59□□□□□ -0.23
ACTB-209ENST00000473257 COBLO75128 1261 aa13.59□□□□□ -0.23
ACTB-209ENST00000473257 AKR1B1P15121 316 aa13.59□□□□□ -0.23
ACTB-209ENST00000473257 CAPN2P17655 700 aa13.59□□□□□ -0.23
ACTB-209ENST00000473257 USP14P54578 494 aa13.59□□□□□ -0.23
ACTB-209ENST00000473257 CCNA1P78396 465 aa13.59□□□□□ -0.23
ACTB-209ENST00000473257 GRB14Q14449 540 aa13.59□□□□□ -0.23
ACTB-209ENST00000473257 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa13.59□□□□□ -0.23
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ACTB-209ENST00000473257 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
ACTB-209ENST00000473257 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
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ACTB-209ENST00000473257 MBD4O95243 580 aa13.58□□□□□ -0.24
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ACTB-209ENST00000473257 COG6Q9Y2V7 657 aa13.58□□□□□ -0.24
ACTB-209ENST00000473257 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa13.58□□□□□ -0.24
ACTB-209ENST00000473257 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa13.58□□□□□ -0.24
ACTB-209ENST00000473257 RLFQ13129 1914 aa13.57□□□□□ -0.24
ACTB-209ENST00000473257 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
ACTB-209ENST00000473257 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
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ACTB-209ENST00000473257 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
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ACTB-209ENST00000473257 CERS3Q8IU89 383 aa13.56□□□□□ -0.24
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ACTB-209ENST00000473257 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa13.56□□□□□ -0.24
ACTB-209ENST00000473257 IGSF3O75054 1194 aa13.55□□□□□ -0.24
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ACTB-209ENST00000473257 LPAR1Q92633 364 aa13.55□□□□□ -0.24
ACTB-209ENST00000473257 FERMT2Q96AC1 680 aa13.55□□□□□ -0.24
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ACTB-209ENST00000473257 USP17L21D6R901 530 aa13.54□□□□□ -0.24
ACTB-209ENST00000473257 RAD21O60216 631 aa13.54□□□□□ -0.24
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ACTB-209ENST00000473257 CDK8P49336 464 aa13.54□□□□□ -0.24
ACTB-209ENST00000473257 ICA1Q05084 483 aa13.54□□□□□ -0.24
ACTB-209ENST00000473257 TMEM132BQ14DG7 1078 aa13.54□□□□□ -0.24
ACTB-209ENST00000473257 C20orf194Q5TEA3 1177 aa13.54□□□□□ -0.24
ACTB-209ENST00000473257 TMEM179Q6ZVK1 233 aa13.54□□□□□ -0.24
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ACTB-209ENST00000473257 A0A0G2JMZ2 1700 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTB-209ENST00000473257 CDH23Q9H251 3354 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTB-209ENST00000473257 DNM1LO00429 736 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTB-209ENST00000473257 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
ACTB-209ENST00000473257 ADCYAP1R1P41586 468 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTB-209ENST00000473257 TRIM60Q495X7 471 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTB-209ENST00000473257 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa13.53□□□□□ -0.24
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ACTB-209ENST00000473257 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTB-209ENST00000473257 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
ACTB-209ENST00000473257 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
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ACTB-209ENST00000473257 TSHZ3Q63HK5 1081 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTB-209ENST00000473257 OLFML2BQ68BL8 750 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTB-209ENST00000473257 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP13.52□□□□□ -0.25
ACTB-209ENST00000473257 GUCD1Q96NT3 240 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTB-209ENST00000473257 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
ACTB-209ENST00000473257 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
ACTB-209ENST00000473257 VCPKMTQ9H867 229 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTB-209ENST00000473257 TMX2Q9Y320 296 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTB-209ENST00000473257 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTB-209ENST00000473257 ZBED9Q6R2W3 1325 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTB-209ENST00000473257 SMCHD1A6NHR9 2005 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTB-209ENST00000473257 MYH8P13535 1937 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTB-209ENST00000473257 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
ACTB-209ENST00000473257 ATP5JP18859 108 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTB-209ENST00000473257 LRRC41Q15345 812 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTB-209ENST00000473257 SHHQ15465 462 aa13.51□□□□□ -0.25
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