RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 VTI1AQ96AJ9 217 aa5.36□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 ITPKCQ96DU7 683 aa5.36□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 SEMA6BQ9H3T3 888 aa5.36□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 AK9Q5TCS8 1911 aa5.36□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 CDH23Q9H251 3354 aa5.36□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 COL4A1P02462 1669 aa5.35□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa5.35□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 MYPNQ86TC9 1320 aa5.35□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 BTBD11A6QL63 1104 aa5.35□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 WNT10BO00744 389 aa5.35□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 NDUFB5O43674 189 aa5.35□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 GDF9O60383 454 aa5.35□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 NOS2P35228 1153 aa5.35□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 PSMC4P43686 418 aa5.35□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 IREB2P48200 963 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 CENPCQ03188 943 aa5.35□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 CBLBQ13191 982 aa5.35□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 MMRN1Q13201 1228 aa5.35□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 RTN1Q16799 776 aa5.35□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 PARP10Q53GL7 1025 aa5.35□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC10A5Q5PT55 438 aa5.35□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 KIF6Q6ZMV9 814 aa5.35□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 DEFB118Q96PH6 123 aa5.35□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 GMLQ99445 158 aa5.35□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 LRFN3Q9BTN0 628 aa5.35□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 POLLQ9UGP5 575 aa5.35□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 FZD1Q9UP38 647 aa5.35□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 V9GY48 417 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 LTBP2Q14767 1821 aa5.34□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 TPRP12270 2363 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 ADGRA2Q96PE1 1338 aa5.34□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa5.34□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 SERTM1A2A2V5 107 aa5.34□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 P4HBP07237 508 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 TIMP2P16035 220 aa5.34□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 GPC1P35052 558 aa5.34□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 GTF2A2P52657 109 aa5.34□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 CCL15Q16663 113 aa5.34□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM31Q5JXX7 168 aa5.34□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa5.34□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 C1orf53Q5VUE5 145 aa5.34□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa5.34□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF34Q8IZ26 560 aa5.34□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 BRI3BPQ8WY22 251 aa5.34□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 OPTNQ96CV9 577 aa5.34□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 DMRTB1Q96MA1 342 aa5.34□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 ASB2Q96Q27 587 aa5.34□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 TOR4AQ9NXH8 423 aa5.34□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 THEGQ9P2T0 379 aa5.34□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 MAST2Q6P0Q8 1798 aa5.34□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 EPG5Q9HCE0 2579 aa5.33□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 GNAT3A8MTJ3 354 aa5.33□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 ZBTB39O15060 712 aa5.33□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 KCNQ3O43525 872 aa5.33□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 SASH1O94885 1247 aa5.33□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 RECKO95980 971 aa5.33□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 HMOX1P09601 288 aa5.33□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 BRD2P25440 801 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 IL13P35225 146 aa5.33□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 MMP14P50281 582 aa5.33□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 GPSM2P81274 684 aa5.33□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 NEUROD1Q13562 356 aa5.33□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa5.33□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa5.33□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 GJD3Q8N144 294 aa5.33□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM43AQ8N2R8 423 aa5.33□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 NGEFQ8N5V2 710 aa5.33□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 MEIOBQ8N635 442 aa5.33□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 USP38Q8NB14 1042 aa5.33□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 IL17REQ8NFR9 667 aa5.33□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 TBC1D16Q8TBP0 767 aa5.33□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 PRKD2Q9BZL6 878 aa5.33□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 GRIP2Q9C0E4 1043 aa5.33□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 DEFB129Q9H1M3 183 aa5.33□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 ZFAND3Q9H8U3 227 aa5.33□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 BRPF3Q9ULD4 1205 aa5.33□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 CHMP3Q9Y3E7 222 aa5.33□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa5.33□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 WASF2Q9Y6W5 498 aa5.33□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 CHD8Q9HCK8 2581 aa5.33□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 BRWD1Q9NSI6 2320 aa5.32□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF318Q5VUA4 2279 aa5.32□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 MYO3BQ8WXR4 1341 aa5.32□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 GPR182O15218 404 aa5.32□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 ADCY3O60266 1144 aa5.32□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 TCF3P15923 654 aa5.32□□□□□ -1.56
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