RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429374.5

HDAC10-204, Transcript of histone deacetylase 10, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HDAC10, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10-204ENST00000429374 ATRNL1Q5VV63 1379 aa21.88■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 KRT2P35908 639 aa21.88■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 FAM160A1Q05DH4 1040 aa21.88■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 PTPAQ15257 358 aa21.88■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 ENGASEQ8NFI3 743 aa21.88■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 FAM198AQ9UFP1 575 aa21.88■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 ZNRF3Q9ULT6 936 aa21.88■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 CD2APQ9Y5K6 639 aa21.88■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 NR1I2O75469 434 aa21.87■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 ZBTB7AO95365 584 aa21.87■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 CALML3P27482 149 aa21.87■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 SHMT1P34896 483 aa21.87■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 NFIAQ12857 509 aa21.87■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 AGBL3Q8NEM8 1001 aa21.87■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 TNMDQ9H2S6 317 aa21.87■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 SIPA1L1O43166 1804 aa21.86■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 CMA1P23946 247 aa21.86■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 UVSSAQ2YD98 709 aa21.86■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 CFAP100Q494V2 611 aa21.86■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 GALNT17Q6IS24 598 aa21.86■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 MTMR14Q8NCE2 650 aa21.86■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 CEP131Q9UPN4 1083 aa21.86■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 CCDC192P0DO97 292 aa21.85■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 NIM1KQ8IY84 436 aa21.85■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 VPS54Q9P1Q0 977 aa21.85■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa21.84■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 TTLL1O95922 423 aa21.84■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 BMP15O95972 392 aa21.84■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 STAG2Q8N3U4 1231 aa21.84■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 FSIP1Q8NA03 581 aa21.84■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 SGIP1Q9BQI5 828 aa21.84■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 PSMD14O00487 310 aa21.84■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 SNHG28P0DPA3 235 aa21.84■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 AKR1B1P15121 316 aa21.84■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 ASPRV1Q53RT3 343 aa21.84■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 FKBP1CQ5VVH2 108 aa21.84■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 TATDN1Q6P1N9 297 aa21.84■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 OGFOD1Q8N543 542 aa21.84■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 SHISA4Q96DD7 197 aa21.84■■□□□ 1.09
HDAC10-204ENST00000429374 KLRF2D3W0D1 207 aa21.83■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 CUTAO60888 179 aa21.83■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 TRAPPC10P48553 1259 aa21.83■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 NPY5RQ15761 445 aa21.83■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 TNFRSF25Q93038 417 aa21.83■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 TMOD2Q9NZR1 351 aa21.83■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 COL4A5P29400 1685 aa21.82■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 SPDYE2BA6NHP3 402 aa21.82■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 KINO60870 393 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 SPDYE6P0CI01 402 aa21.82■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 NR5A1Q13285 461 aa21.82■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 TPRNQ4KMQ1 711 aa21.82■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 CCDC148Q8NFR7 591 aa21.82■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa21.82■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 LTBP3Q9NS15 1303 aa21.82■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 hCG_1984214I3L0E3 225 aa21.81■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 CAVIN2O95810 425 aa21.81■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 ZFPM1Q8IX07 1006 aa21.81■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 DAGLBQ8NCG7 672 aa21.81■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 OXER1Q8TDS5 423 aa21.81■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 MKL1Q969V6 931 aa21.81■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 TIGD1Q96MW7 591 aa21.81■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 PANK2Q9BZ23 570 aa21.81■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa21.81■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 CYTH3O43739 400 aa21.8■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 NLRP5P59047 1200 aa21.8■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 CCDC173Q0VFZ6 552 aa21.8■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 DLGAP5Q15398 846 aa21.8■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa21.8■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 TAOK3Q9H2K8 898 aa21.8■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 RIOX1Q9H6W3 641 aa21.8■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 BARHL2Q9NY43 387 aa21.8■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 NYAP2Q9P242 653 aa21.8■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 RAD17O75943 681 aa21.8■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 PDHBP11177 359 aa21.8■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 PPP1R9BQ96SB3 815 aa21.8■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 DNAJC18Q9H819 358 aa21.8■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 KANSL2Q9H9L4 492 aa21.8■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 CABP5Q9NP86 173 aa21.8■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 MYH4Q9Y623 1939 aa21.8■■□□□ 1.08
HDAC10-204ENST00000429374 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms