RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 ZDHHC15Q96MV8 337 aa8.23□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 WRNIP1Q96S55 665 aa8.23□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 CSADQ9Y600 493 aa8.23□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa8.22□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 TLR2O60603 784 aa8.22□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 INPP5BP32019 993 aa8.22□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 MOGSQ13724 837 aa8.22□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 QPCTQ16769 361 aa8.22□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 TUSC1Q2TAM9 212 aa8.22□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.22□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 MIGA2Q7L4E1 593 aa8.22□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 FAM83AQ86UY5 434 aa8.22□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 VPS37DQ86XT2 251 aa8.22□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 ERO1BQ86YB8 467 aa8.22□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 FAM9BQ8IZU0 186 aa8.22□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa8.22□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 TEKT1Q969V4 418 aa8.22□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 GCC1Q96CN9 775 aa8.22□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 MRIQ9BWK5 157 aa8.22□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 USP44Q9H0E7 712 aa8.22□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 CETPP11597 493 aa8.21□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP8.21□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 PPIL2Q13356 520 aa8.21□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa8.21□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 CAVIN4Q5BKX8 364 aa8.21□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 HHIPL2Q6UWX4 724 aa8.21□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 PARP9Q8IXQ6 854 aa8.21□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP8.21□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 ADGRA2Q96PE1 1338 aa8.21□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 ANP32CO43423 234 aa8.21□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 LILRB3O75022 631 aa8.21□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 ZMYND10O75800 440 aa8.21□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 NFIAQ12857 509 aa8.21□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 MTFR1Q15390 333 aa8.21□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 FKBP1CQ5VVH2 108 aa8.21□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 C17orf99Q6UX52 265 aa8.21□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 ATG9AQ7Z3C6 839 aa8.21□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 ZFPM1Q8IX07 1006 aa8.21□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 SSH1Q8WYL5 1049 aa8.21□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 SHISA4Q96DD7 197 aa8.21□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 AGBL1Q96MI9 1066 aa8.21□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 LIMD1Q9UGP4 676 aa8.21□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 CPA4Q9UI42 421 aa8.21□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF112Q9UJU3 913 aa8.21□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa8.21□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 KIF16BQ96L93 1317 aa8.2□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 EYA2O00167 538 aa8.2□□□□□ -1.1
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HOXD8-202ENST00000429017 SNAPC2Q13487 334 aa8.2□□□□□ -1.1
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HOXD8-202ENST00000429017 TMOD2Q9NZR1 351 aa8.19□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 MYH13Q9UKX3 1938 aa8.19□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 ATRNL1Q5VV63 1379 aa8.18□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 MAST3O60307 1309 aa8.18□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 PTPRCP08575 1304 aa8.18□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 H0YGN5 161 aa8.18□□□□□ -1.1
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HOXD8-202ENST00000429017 MAP3K10Q02779 954 aa8.18□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 ARHGEF6Q15052 776 aa8.18□□□□□ -1.1
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HOXD8-202ENST00000429017 DCAF15Q66K64 600 aa8.18□□□□□ -1.1
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HOXD8-202ENST00000429017 SRRDQ9UH36 339 aa8.18□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 PHF20L1A8MW92 1017 aa8.18□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 SLC5A1P13866 664 aa8.18□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 ADORA1P30542 326 aa8.18□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 PHKA1P46020 1223 aa8.18□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 KIF22Q14807 665 aa8.18□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa8.18□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 WDR66Q8TBY9 1149 aa8.18□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.18□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 SIL1Q9H173 461 aa8.18□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 USP40Q9NVE5 1235 aa8.18□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 RFX7Q2KHR2 1363 aa8.17□□□□□ -1.1
HOXD8-202ENST00000429017 CYP2C8P10632 490 aa8.17□□□□□ -1.1
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