RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF827Q17R98 1081 aa9.84□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 GEN1Q17RS7 908 aa9.84□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa9.84□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 MCM9Q9NXL9 1143 aa9.84□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 WWC3Q9ULE0 1092 aa9.84□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 KCNJ14Q9UNX9 436 aa9.84□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 COPRSQ9NQ92 184 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 GLI2P10070 1586 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 A0A087WWV3 80 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 CEP85LQ5SZL2 805 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 MYSM1Q5VVJ2 828 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 ADALQ6DHV7 355 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 SV2BQ7L1I2 683 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC89Q8N998 374 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 MAP4K1Q92918 833 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 TPCN1Q9ULQ1 816 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 ERBB4Q15303 1308 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 SH3TC1Q8TE82 1336 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 E9PCH4 1651 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 SPOPO43791 374 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 DEXIO95424 95 aa9.83□□□□□ -0.84
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PTPRM-202ENST00000400053 EPSTI1Q96J88 318 aa9.83□□□□□ -0.84
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PTPRM-202ENST00000400053 FANCLQ9NW38 375 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 SERTAD1Q9UHV2 236 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 PDE8AO60658 829 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 PPFIA2O75334 1257 aa9.83□□□□□ -0.84
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PTPRM-202ENST00000400053 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 ACSBG1Q96GR2 724 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 STK24Q9Y6E0 443 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 MED14O60244 1454 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 FAM170AA1A519 330 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 PRDM1O75626 825 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 CCT5P48643 541 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 ARHGEF25Q86VW2 580 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 BLZF1Q9H2G9 400 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP9.82□□□□□ -0.843e-7■■■□□ 14.9
PTPRM-202ENST00000400053 TMOD4Q9NZQ9 345 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 ADGRB3O60242 1522 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa9.82□□□□□ -0.84
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PTPRM-202ENST00000400053 E7EWF7 191 aa9.82□□□□□ -0.84
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PTPRM-202ENST00000400053 WDR44Q5JSH3 913 aa9.82□□□□□ -0.84
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PTPRM-202ENST00000400053 SH2D4AQ9H788 454 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 ABCA6Q8N139 1617 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 GCKP35557 465 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 PLCD1P51178 756 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF131P52739 623 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 KIFC2Q96AC6 838 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 TTC36A6NLP5 189 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 CETN3O15182 167 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 PARP10Q53GL7 1025 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 LIN9Q5TKA1 542 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC65Q8IXS2 484 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC170Q8IYT3 715 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 GLT8D2Q9H1C3 349 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 STK38LQ9Y2H1 464 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 PTPN21Q16825 1174 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa9.81□□□□□ -0.84
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PTPRM-202ENST00000400053 TYW1BQ6NUM6 668 aa9.81□□□□□ -0.84
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PTPRM-202ENST00000400053 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 NLRC4Q9NPP4 1024 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 F8W031 263 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 RFC4P35249 363 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 TCIRG1Q13488 830 aa9.81□□□□□ -0.84
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PTPRM-202ENST00000400053 CCDC62Q6P9F0 684 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 BANK1Q8NDB2 785 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 OR8K1Q8NGG5 319 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 NELFBQ8WX92 580 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 NUP58Q9BVL2 599 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 CAPS2Q9BXY5 557 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 JAG2Q9Y219 1238 aa9.81□□□□□ -0.84
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