RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 HAND2P61296 217 aa17.75■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 CEP95Q96GE4 821 aa17.75■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 PAGR1Q9BTK6 254 aa17.75■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 NBPF3Q9H094 633 aa17.75■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF287Q9HBT7 754 aa17.75■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 RBPJLQ9UBG7 517 aa17.75■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 MORF4L1Q9UBU8 362 aa17.75■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 SRRDQ9UH36 339 aa17.75■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 CNMDO75829 334 aa17.74■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 PRKCZQ05513 592 aa17.74■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 SH2D4AQ9H788 454 aa17.74■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 NYAP2Q9P242 653 aa17.74■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 GABRQQ9UN88 632 aa17.74■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 MYPNQ86TC9 1320 aa17.73■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 RLFQ13129 1914 aa17.73■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 GNRH1P01148 92 aa17.73■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 TSPY3P0CV98 308 aa17.73■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 TSPY8P0CW00 308 aa17.73■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 CHMLP26374 656 aa17.73■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 TFAP4Q01664 338 aa17.73■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 Q3C1V9 767 aa17.73■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 TBC1D10CQ8IV04 446 aa17.73■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 NEDD1Q8NHV4 660 aa17.73■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 NKX2-3Q8TAU0 364 aa17.73■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 LPAR1Q92633 364 aa17.73■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC136Q96JN2 1154 aa17.73■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 TANGO6Q9C0B7 1094 aa17.73■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 MTMR4Q9NYA4 1195 aa17.73■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 NEFLP07196 543 aa17.72■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 FGRP09769 529 aa17.72■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 ERVK-9P63128 1117 aa17.72■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 ERVK-24P63145 666 aa17.72■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 DSCC1Q9BVC3 393 aa17.72■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 BTBD7Q9P203 1132 aa17.72■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 CLIP2Q9UDT6 1046 aa17.72■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 MYH4Q9Y623 1939 aa17.72■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 LAMA4Q16363 1823 aa17.72■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 TSPY2A6NKD2 308 aa17.71■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 WDR46O15213 610 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 ORC4O43929 436 aa17.71■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 RAD21O60216 631 aa17.71■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 NMT2O60551 498 aa17.71■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 HOXD10P28358 340 aa17.71■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 PRMT2P55345 433 aa17.71■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 SOX10P56693 466 aa17.71■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 LBX2Q6XYB7 198 aa17.71■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa17.71■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 SH3TC2Q8TF17 1288 aa17.71■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 PORCNQ9H237 461 aa17.71■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 GOPCQ9HD26 462 aa17.71■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 A0A0G2JMZ2 1700 aa17.71■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 RAD50Q92878 1312 aa17.71■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 DOCK3Q8IZD9 2030 aa17.71■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 CENPFP49454 3210 aa17.7■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 PARP14Q460N5 1801 aa17.7■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 FAM83BQ5T0W9 1011 aa17.7■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 STAG1Q8WVM7 1258 aa17.7■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 ARMC5Q96C12 935 aa17.7■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 ATG4CQ96DT6 458 aa17.7■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 IL17RBQ9NRM6 502 aa17.7■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 TOMM22Q9NS69 142 aa17.7■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 FBXO28Q9NVF7 368 aa17.7■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa17.7■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 NEDD4P46934 1319 aa17.7■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 F5H6K3 240 aa17.69■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 FLOT1O75955 427 aa17.69■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 TTLL1O95922 423 aa17.69■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 NDUFB10O96000 172 aa17.69■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 DSG3P32926 999 aa17.69■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 FLT3LGP49771 235 aa17.69■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 KLRC3Q07444 240 aa17.69■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 COG2Q14746 738 aa17.69■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa17.69■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 AKNAD1Q5T1N1 836 aa17.69■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 RAET1EQ8TD07 263 aa17.69■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 MKL1Q969V6 931 aa17.69■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF333Q96JL9 665 aa17.69■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 PLXNB2O15031 1838 aa17.68■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 SGSM2O43147 1006 aa17.68■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 PTH1RQ03431 593 aa17.68■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 COA7Q96BR5 231 aa17.68■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF213O14771 459 aa17.67■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 MFSD6Q6ZSS7 791 aa17.67■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 RASGRP2Q7LDG7 609 aa17.67■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 RUFY2Q8WXA3 655 aa17.67■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 GJD2Q9UKL4 321 aa17.67■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 STX8Q9UNK0 236 aa17.67■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 MYCP01106 439 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 GRK4P32298 578 aa17.66■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 GPR142Q7Z601 462 aa17.66■□□□□ 0.42
CSAG1-201ENST00000361211 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms