RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307106.3

SMIM4-201, Transcript of small integral membrane protein 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMIM4, Length 274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM4-201ENST00000307106 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SMIM4-201ENST00000307106 REV3LO60673 3130 aa14.55□□□□□ -0.08
SMIM4-201ENST00000307106 MCM3APO60318 1980 aa14.54□□□□□ -0.08
SMIM4-201ENST00000307106 MCAMP43121 646 aa14.54□□□□□ -0.08
SMIM4-201ENST00000307106 PPP4CP60510 307 aa14.54□□□□□ -0.08
SMIM4-201ENST00000307106 RAB3GAP1Q15042 981 aa14.54□□□□□ -0.08
SMIM4-201ENST00000307106 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SMIM4-201ENST00000307106 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SMIM4-201ENST00000307106 TMEM39AQ9NV64 488 aa14.54□□□□□ -0.08
SMIM4-201ENST00000307106 COBLO75128 1261 aa14.53□□□□□ -0.08
SMIM4-201ENST00000307106 PBX2P40425 430 aa14.53□□□□□ -0.08
SMIM4-201ENST00000307106 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SMIM4-201ENST00000307106 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa14.53□□□□□ -0.08
SMIM4-201ENST00000307106 ADGRA1Q86SQ6 560 aa14.53□□□□□ -0.08
SMIM4-201ENST00000307106 ACER1Q8TDN7 264 aa14.53□□□□□ -0.08
SMIM4-201ENST00000307106 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
SMIM4-201ENST00000307106 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa14.53□□□□□ -0.08
SMIM4-201ENST00000307106 PBX4Q9BYU1 374 aa14.53□□□□□ -0.08
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SMIM4-201ENST00000307106 SLC5A4Q9NY91 659 aa14.53□□□□□ -0.08
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SMIM4-201ENST00000307106 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SMIM4-201ENST00000307106 A0A1W2PQY0 241 aa14.52□□□□□ -0.09
SMIM4-201ENST00000307106 RARBP10826 455 aa14.52□□□□□ -0.09
SMIM4-201ENST00000307106 ERCC3P19447 782 aa14.52□□□□□ -0.09
SMIM4-201ENST00000307106 TATDN1Q6P1N9 297 aa14.52□□□□□ -0.09
SMIM4-201ENST00000307106 RNF180Q86T96 592 aa14.52□□□□□ -0.09
SMIM4-201ENST00000307106 SLC44A5Q8NCS7 719 aa14.52□□□□□ -0.09
SMIM4-201ENST00000307106 SPATC1LQ9H0A9 340 aa14.52□□□□□ -0.09
SMIM4-201ENST00000307106 GRXCR1A8MXD5 290 aa14.51□□□□□ -0.09
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SMIM4-201ENST00000307106 MAML3Q96JK9 1138 aa14.51□□□□□ -0.09
SMIM4-201ENST00000307106 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SMIM4-201ENST00000307106 LRRC37A2A6NM11 1700 aa14.5□□□□□ -0.09
SMIM4-201ENST00000307106 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa14.5□□□□□ -0.09
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SMIM4-201ENST00000307106 ABCB5Q2M3G0 1257 aa14.5□□□□□ -0.09
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SMIM4-201ENST00000307106 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa14.5□□□□□ -0.09
SMIM4-201ENST00000307106 TOX2Q96NM4 488 aa14.5□□□□□ -0.09
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SMIM4-201ENST00000307106 CHD9Q3L8U1 2897 aa14.5□□□□□ -0.09
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SMIM4-201ENST00000307106 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SMIM4-201ENST00000307106 ROBO3Q96MS0 1386 aa14.48□□□□□ -0.09
SMIM4-201ENST00000307106 ZNF521Q96K83 1311 aa14.48□□□□□ -0.09
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SMIM4-201ENST00000307106 ALDH1L2Q3SY69 923 aa14.48□□□□□ -0.09
SMIM4-201ENST00000307106 TMEM240Q5SV17 173 aa14.48□□□□□ -0.09
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SMIM4-201ENST00000307106 EHD4Q9H223 541 aa14.48□□□□□ -0.09
SMIM4-201ENST00000307106 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SMIM4-201ENST00000307106 STARD7Q9NQZ5 370 aa14.48□□□□□ -0.09
SMIM4-201ENST00000307106 SMC4Q9NTJ3 1288 aa14.48□□□□□ -0.09
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SMIM4-201ENST00000307106 TBX21Q9UL17 535 aa14.48□□□□□ -0.09
SMIM4-201ENST00000307106 CHD7Q9P2D1 2997 aa14.48□□□□□ -0.09
SMIM4-201ENST00000307106 FCER1AP12319 257 aa14.47□□□□□ -0.09
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SMIM4-201ENST00000307106 MB21D1Q8N884 522 aa14.47□□□□□ -0.09
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SMIM4-201ENST00000307106 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
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SMIM4-201ENST00000307106 AKR1A1P14550 325 aa14.46□□□□□ -0.09
SMIM4-201ENST00000307106 GUCY1A2P33402 732 aa14.46□□□□□ -0.09
SMIM4-201ENST00000307106 ACLYP53396 1101 aa14.46□□□□□ -0.09
SMIM4-201ENST00000307106 MTX1Q13505 466 aa14.46□□□□□ -0.09
SMIM4-201ENST00000307106 TTC39AQ5SRH9 613 aa14.46□□□□□ -0.09
SMIM4-201ENST00000307106 TTC6Q86TZ1 520 aa14.46□□□□□ -0.09
SMIM4-201ENST00000307106 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
SMIM4-201ENST00000307106 TINF2Q9BSI4 451 aa14.46□□□□□ -0.09
SMIM4-201ENST00000307106 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
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