RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000103059.1

Col9a3-201, Transcript of Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Col9a3, Length 2,846 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Ugt1a7cQ6ZQM8 531 aa14.97□□□□□ -0.01
Col9a3-201ENSMUST00000103059 MycbpQ9EQS3 103 aa14.97□□□□□ -0.01
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Gjb4Q02738 266 aa14.96□□□□□ -0.01
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Cep85Q8BMK0 761 aa14.96□□□□□ -0.01
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Gimap7Q8R379 293 aa14.96□□□□□ -0.01
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Mtmr6Q8VE11 617 aa14.96□□□□□ -0.01
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Dynll2Q9D0M5 89 aa14.96□□□□□ -0.01
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Gm36210A0A1B0GS00 229 aa14.96□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Diaph1O08808 1255 aa14.96□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Calm1P0DP26 149 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Calm2P0DP27 149 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Calm3P0DP28 149 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Rad23bP54728 416 aa14.96□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Aak1Q3UHJ0 959 aa14.96□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Sun3Q5SS91 320 aa14.96□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 CtcfQ61164 736 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Ccdc57Q6PHN1 1016 aa14.96□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Sh2b1Q91ZM2 756 aa14.96□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Gm43738A0A0G2JEA5 862 aa14.95□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Exoc3l2D3YUP5 789 aa14.95□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Acad12D3Z7X0 555 aa14.95□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Gng11P61953 73 aa14.95□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 NfixP70257 488 aa14.95□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Slc7a1Q09143 622 aa14.95□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Apobec3Q99J72 440 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Eif4enif1Q9EST3 983 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Lmbr1Q9JIT0 490 aa14.95□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Cacna1sQ02789 1880 aa14.95□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 MarcksP26645 309 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Q66JV7 365 aa14.95□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Ppp2r2cQ8BG02 447 aa14.95□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Pde5aQ8CG03 865 aa14.95□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Sox30Q8CGW4 782 aa14.95□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Bicdl2Q8CHW5 507 aa14.95□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Tgs1Q923W1 853 aa14.95□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Tab2Q99K90 693 aa14.95□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Cyp26c1B2RXA7 518 aa14.94□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Pla2g4bP0C871 782 aa14.94□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Mdh1bQ5F204 500 aa14.94□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Bag1Q60739 355 aa14.94□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 DlatQ8BMF4 642 aa14.94□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Tmx4Q8C0L0 335 aa14.94□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Lrit1Q8K099 624 aa14.94□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Dydc2Q9D3X8 139 aa14.94□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Hspa1lP16627 641 aa14.94□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Cep131Q62036 1060 aa14.94□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Ces3aQ63880 571 aa14.94□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Ankk1Q8BZ25 745 aa14.94□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Ces3bQ8VCU1 571 aa14.94□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Gpaa1Q9WTK3 621 aa14.94□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 A0A0U1RNP2 1173 aa14.93□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Cyp2j7A0A140T8U1 504 aa14.93□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Il7P10168 154 aa14.93□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 LtbrP50284 415 aa14.93□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Spg7Q3ULF4 781 aa14.93□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Ankrd40Q5SUE8 363 aa14.93□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Tas2r124Q7M718 309 aa14.93□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Cct8l1Q80YT3 562 aa14.93□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Trim29Q8R2Q0 587 aa14.93□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Brms1Q99N20 246 aa14.93□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Ccdc83Q9D4V3 305 aa14.93□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Cbx6Q9DBY5 414 aa14.93□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Plch1Q4KWH5 1682 aa14.93□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Gucy1a2F8VQK3 730 aa14.93□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Ftl1P29391 183 aa14.93□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Specc1lQ2KN98 1118 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Ccdc114Q3UX62 658 aa14.93□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Gga3Q8BMI3 718 aa14.93□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Iqcb1Q8BP00 598 aa14.93□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Vps53Q8CCB4 832 aa14.93□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Ppp2r3dQ9Z176 491 aa14.93□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Sh3tc1G3X9F6 1346 aa14.93□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Api5O35841 504 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Mdh1P14152 334 aa14.93□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 TxlnaQ6PAM1 554 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Brd3Q8K2F0 726 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Ndufv1Q91YT0 464 aa14.93□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Nek3Q9R0A5 511 aa14.93□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Stag2O35638 1231 aa14.92□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Eif5P59325 429 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Kiaa1468Q148V7 1216 aa14.92□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 PsdQ5DTT2 1024 aa14.92□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Pramel6Q810Y9 485 aa14.92□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Nek9Q8K1R7 984 aa14.92□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Amhr2Q8K592 568 aa14.92□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Hexim1Q8R409 356 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Smc1bQ920F6 1248 aa14.92□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Pla2g12bQ99P27 195 aa14.92□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Cbx8Q9QXV1 362 aa14.92□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Tmtc2Q56A06 836 aa14.92□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Acbd5Q5XG73 508 aa14.92□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Drc7Q6V3W6 876 aa14.92□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Cd209bQ8CJ91 325 aa14.92□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Cgref1Q8R1U2 281 aa14.92□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Zfyve9A2A8R0 1397 aa14.92□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Rsph10bE9PYQ0 876 aa14.91□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Trim55G3X8Y1 545 aa14.91□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 InhbeO08717 350 aa14.91□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 NefhP19246 1090 aa14.91□□□□□ -0.02
Col9a3-201ENSMUST00000103059 Mars2Q499X9 586 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.8 ms