RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 FERMT3Q86UX7 667 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC17Q96LX7 622 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC26A6Q9BXS9 759 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 TMOD2Q9NZR1 351 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 CNPY2Q9Y2B0 182 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 MYH8P13535 1937 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 TCHHQ07283 1943 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 PPFIA3O75145 1194 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 DEXIO95424 95 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 PRELPP51888 382 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 CACNB3P54284 484 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 RASSF7Q02833 373 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 KLHL40Q2TBA0 621 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 PNMA1Q8ND90 353 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM47Q9BQJ4 181 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
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CAPNS1-207ENST00000589146 ATL3Q6DD88 541 aa26.46■■□□□ 1.83
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CAPNS1-207ENST00000589146 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-207ENST00000589146 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
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CAPNS1-207ENST00000589146 MYH15Q9Y2K3 1946 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-207ENST00000589146 AKR1B1P15121 316 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-207ENST00000589146 GNAQP50148 359 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-207ENST00000589146 TATDN1Q6P1N9 297 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM151AQ8WW52 585 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-207ENST00000589146 DPF2Q92785 391 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-207ENST00000589146 CEP95Q96GE4 821 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-207ENST00000589146 DNAJC18Q9H819 358 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-207ENST00000589146 MTMR4Q9NYA4 1195 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-207ENST00000589146 PLEKHA8P1O95397 391 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-207ENST00000589146 FOSBP53539 338 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-207ENST00000589146 EIF6P56537 245 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
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CAPNS1-207ENST00000589146 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-207ENST00000589146 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-207ENST00000589146 ELP1O95163 1332 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-207ENST00000589146 MBD3O95983 291 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-207ENST00000589146 GUCY1B3Q02153 619 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-207ENST00000589146 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-207ENST00000589146 BRAPQ7Z569 592 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM83AQ86UY5 434 aa26.42■■□□□ 1.82
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CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM29Q14134 588 aa26.41■■□□□ 1.82
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CAPNS1-207ENST00000589146 MYOZ2Q9NPC6 264 aa26.41■■□□□ 1.82
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CAPNS1-207ENST00000589146 STX8Q9UNK0 236 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-207ENST00000589146 CNTNAP1P78357 1384 aa26.41■■□□□ 1.82
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CAPNS1-207ENST00000589146 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-207ENST00000589146 PKN1Q16512 942 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-207ENST00000589146 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-207ENST00000589146 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-207ENST00000589146 GDPD2Q9HCC8 539 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-207ENST00000589146 MAD2L2Q9UI95 211 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-207ENST00000589146 CFAP45Q9UL16 551 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-207ENST00000589146 MYH6P13533 1939 aa26.39■■□□□ 1.82
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CAPNS1-207ENST00000589146 NCLP19338 710 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-207ENST00000589146 SMARCA1P28370 1054 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-207ENST00000589146 GPT2Q8TD30 523 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
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CAPNS1-207ENST00000589146 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-207ENST00000589146 CLRN2A0PK11 232 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 UBE2Q2LH0YL09 131 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 FIBPO43427 364 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 UBE2HP62256 183 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 TCP10L2B9ZVM9 353 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 WNT10BO00744 389 aa26.37■■□□□ 1.81
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CAPNS1-207ENST00000589146 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC82Q8N4S0 544 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM34Q9BYJ4 488 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 V9GY48 417 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 TBC1D12O60347 775 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 MMP1P03956 469 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-207ENST00000589146 LMNB1P20700 586 aa26.36■■□□□ 1.81
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