RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
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CTIF-205ENST00000587860 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
CTIF-205ENST00000587860 RASGRP4Q8TDF6 673 aa17.23■□□□□ 0.35
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CTIF-205ENST00000587860 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
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CTIF-205ENST00000587860 RESP18Q5W5W9 173 aa17.22■□□□□ 0.35
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CTIF-205ENST00000587860 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP17.21■□□□□ 0.35
CTIF-205ENST00000587860 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
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CTIF-205ENST00000587860 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
CTIF-205ENST00000587860 UBE4AQ14139 1066 aa17.2■□□□□ 0.34
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CTIF-205ENST00000587860 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
CTIF-205ENST00000587860 EFCC1Q9HA90 598 aa17.2■□□□□ 0.34
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CTIF-205ENST00000587860 CATIPQ7Z7H3 387 aa17.19■□□□□ 0.34
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CTIF-205ENST00000587860 CUTAO60888 179 aa17.18■□□□□ 0.34
CTIF-205ENST00000587860 PTPN14Q15678 1187 aa17.18■□□□□ 0.34
CTIF-205ENST00000587860 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa17.18■□□□□ 0.34
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CTIF-205ENST00000587860 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
CTIF-205ENST00000587860 ADKP55263 362 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
CTIF-205ENST00000587860 OLFM4Q6UX06 510 aa17.17■□□□□ 0.34
CTIF-205ENST00000587860 CLEC4GQ6UXB4 293 aa17.17■□□□□ 0.34
CTIF-205ENST00000587860 TPTE2Q6XPS3 522 aa17.17■□□□□ 0.34
CTIF-205ENST00000587860 FBXO33Q7Z6M2 555 aa17.17■□□□□ 0.34
CTIF-205ENST00000587860 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa17.17■□□□□ 0.34
CTIF-205ENST00000587860 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
CTIF-205ENST00000587860 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa17.17■□□□□ 0.34
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