RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

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Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
GCSHP2-201ENST00000560971 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.22■■□□□ 1.15
GCSHP2-201ENST00000560971 FEZ1Q99689 392 aa22.22■■□□□ 1.15
GCSHP2-201ENST00000560971 NAPBQ9H115 298 aa22.22■■□□□ 1.15
GCSHP2-201ENST00000560971 TRIM17Q9Y577 477 aa22.22■■□□□ 1.15
GCSHP2-201ENST00000560971 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.22■■□□□ 1.15
GCSHP2-201ENST00000560971 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.21■■□□□ 1.15
GCSHP2-201ENST00000560971 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.21■■□□□ 1.15
GCSHP2-201ENST00000560971 CCDC17Q96LX7 622 aa22.21■■□□□ 1.15
GCSHP2-201ENST00000560971 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa22.21■■□□□ 1.15
GCSHP2-201ENST00000560971 A0A1W2PRG0 241 aa22.2■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 BCRP11274 1271 aa22.2■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 RASA1P20936 1047 aa22.2■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.2■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.2■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.2■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 PRDM1O75626 825 aa22.19■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 OSBPP22059 807 aa22.19■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 PPARAQ07869 468 aa22.19■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 EFCC1Q9HA90 598 aa22.19■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.19■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 PNMA3Q9UL41 463 aa22.19■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.18■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 CTGFP29279 349 aa22.18■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 USP14P54578 494 aa22.18■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 SKAP1Q86WV1 359 aa22.18■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 HTTP42858 3142 aa22.18■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 ICA1Q05084 483 aa22.17■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 C12orf42Q96LP6 360 aa22.17■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 MYH8P13535 1937 aa22.17■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 HIP1O00291 1037 aa22.16■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 FGAP02671 866 aa22.16■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 VCAM1P19320 739 aa22.16■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.16■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 KIF22Q14807 665 aa22.16■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 ALX1Q15699 326 aa22.16■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.16■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 INCENPQ9NQS7 918 aa22.16■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.15■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 PSMC4P43686 418 aa22.15■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 ATP2B2Q01814 1243 aa22.15■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.15■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 TRIM47Q96LD4 638 aa22.15■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.15■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.15■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.15■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.15■■□□□ 1.14
GCSHP2-201ENST00000560971 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.14■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 PEX10O60683 326 aa22.14■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 NEFLP07196 543 aa22.14■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 PDE4BQ07343 736 aa22.14■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 ARHGEF6Q15052 776 aa22.14■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.14■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 TMX2Q9Y320 296 aa22.14■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.14■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 USP17L15C9J2P7 530 aa22.13■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.13■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 USP17L11C9JVI0 530 aa22.13■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 USP17L18D6R9N7 530 aa22.13■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 USP17L22D6RA61 530 aa22.13■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.13■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 USP17L19D6RCP7 530 aa22.13■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 USP17L20D6RJB6 530 aa22.13■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 HERVK_113P62684 666 aa22.13■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 USP17L24Q0WX57 530 aa22.13■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.13■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.13■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 IL25Q9H293 177 aa22.13■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.12■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.12■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.12■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.12■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 CENPFP49454 3210 aa22.11■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.11■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.11■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 SH2D4AQ9H788 454 aa22.11■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.11■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 ZMYM6O95789 1325 aa22.1■■□□□ 1.13
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