RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556355.5

SRP54-AS1-203, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SRP54-AS1, Length 603 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-203ENST00000556355 H3BS24 57 aa6.72□□□□□ -1.33
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ST13P50502 369 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PDE4BQ07343 736 aa6.72□□□□□ -1.33
SRP54-AS1-203ENST00000556355 C22orf34Q6ZV56 151 aa6.72□□□□□ -1.33
SRP54-AS1-203ENST00000556355 HS2ST1Q7LGA3 356 aa6.72□□□□□ -1.33
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CDH24Q86UP0 819 aa6.72□□□□□ -1.33
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ZNF654Q8IZM8 581 aa6.72□□□□□ -1.33
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SEMA3GQ9NS98 782 aa6.72□□□□□ -1.33
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa6.72□□□□□ -1.33
SRP54-AS1-203ENST00000556355 USP31Q70CQ4 1352 aa6.71□□□□□ -1.33
SRP54-AS1-203ENST00000556355 C8AP07357 584 aa6.71□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CYP7A1P22680 504 aa6.71□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SLC6A19Q695T7 634 aa6.71□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PHC3Q8NDX5 983 aa6.71□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TMEM87BQ96K49 555 aa6.71□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TANGO6Q9C0B7 1094 aa6.71□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 LMCD1Q9NZU5 365 aa6.71□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 VPS37DQ86XT2 251 aa6.7□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 FLAD1Q8NFF5 587 aa6.7□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TMEM40Q8WWA1 233 aa6.7□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 UBE2FQ969M7 185 aa6.7□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ST14Q9Y5Y6 855 aa6.7□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 BPNT1O95861 308 aa6.69□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ATP2B1P20020 1258 aa6.69□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 USP48Q86UV5 1035 aa6.69□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ZSWIM9Q86XI8 627 aa6.69□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 COX4I2Q96KJ9 171 aa6.69□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TINF2Q9BSI4 451 aa6.69□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ACBD3Q9H3P7 528 aa6.69□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ZSWIM5Q9P217 1185 aa6.69□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 GGT7Q9UJ14 662 aa6.69□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CTNND2Q9UQB3 1225 aa6.69□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa6.69□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CORINQ9Y5Q5 1042 aa6.69□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ETV3P41162 512 aa6.68□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 KIR3DL1P43629 444 aa6.68□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TNK2Q07912 1038 aa6.68□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 KCNMB1Q16558 191 aa6.68□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.68□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 UPK3BL1B0FP48 263 aa6.67□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 UPK3BL2E5RIL1 263 aa6.67□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 F13A1P00488 732 aa6.67□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PF4P02776 101 aa6.67□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PLCG1P19174 1290 aa6.67□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 AFMP43652 599 aa6.67□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.67□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RELL1Q8IUW5 271 aa6.67□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CILPO75339 1184 aa6.66□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CANXP27824 592 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 LMNB2Q03252 620 aa6.66□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ARID5AQ03989 594 aa6.66□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 FZD5Q13467 585 aa6.66□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 FYB2Q5VWT5 728 aa6.66□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 FAM13CQ8NE31 585 aa6.66□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 DNAJB8Q8NHS0 232 aa6.66□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 GATAD2BQ8WXI9 593 aa6.66□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ARMC5Q96C12 935 aa6.66□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CEP131Q9UPN4 1083 aa6.66□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 FAM221AA4D161 298 aa6.65□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.65□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 LRRC10BA6NIK2 292 aa6.65□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 MINDY4BA8MYZ0 360 aa6.65□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 FAM160A1Q05DH4 1040 aa6.65□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ZNF124Q15973 351 aa6.65□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ZNF394Q53GI3 561 aa6.65□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TMEM74Q96NL1 305 aa6.65□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 GMLQ99445 158 aa6.65□□□□□ -1.34
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TNNI2P48788 182 aa6.64□□□□□ -1.35
SRP54-AS1-203ENST00000556355 YARSP54577 528 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RACK1P63244 317 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PWP1Q13610 501 aa6.64□□□□□ -1.35
SRP54-AS1-203ENST00000556355 MLANAQ16655 118 aa6.64□□□□□ -1.35
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SNAP47Q5SQN1 464 aa6.64□□□□□ -1.35
SRP54-AS1-203ENST00000556355 KSR1Q8IVT5 923 aa6.64□□□□□ -1.35
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa6.64□□□□□ -1.35
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa6.64□□□□□ -1.35
SRP54-AS1-203ENST00000556355 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SRP54-AS1-203ENST00000556355 KIRREL1Q96J84 757 aa6.64□□□□□ -1.35
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RHOVQ96L33 236 aa6.64□□□□□ -1.35
SRP54-AS1-203ENST00000556355 Q96M66 194 aa6.64□□□□□ -1.35
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ALPK1Q96QP1 1244 aa6.64□□□□□ -1.35
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RSRP1Q9BUV0 290 aa6.64□□□□□ -1.35
SRP54-AS1-203ENST00000556355 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.64□□□□□ -1.35
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