RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536089.5

MDM2-223, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 1 (best)

Gene MDM2, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	TP53INP1	Q96A56	240 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	USP21	Q9UK80	565 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	TM4SF5	O14894	197 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	FANCG	O15287	622 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	DDR2	Q16832	855 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	ARSH	Q5FYA8	562 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	TTC6	Q86TZ1	520 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	SNTG2	Q9NY99	539 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	MEGF11	A6BM72	1044 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	ADH5	P11766	374 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	ASPA	P45381	313 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	CASP7	P55210	303 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	TTLL4	Q14679	1199 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	LCE3B	Q5TA77	95 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	ILDR2	Q71H61	639 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	HID1	Q8IV36	788 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	5.93	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	KCT2	Q8NC54	265 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	RNF214	Q8ND24	703 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	ATG4C	Q96DT6	458 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		5.93	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	KIF27	Q86VH2	1401 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089		A0A1W2PQH9	124 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	DRD2	P14416	443 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	USP11	P51784	963 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	SDE2	Q6IQ49	451 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	RNF112	Q9ULX5	631 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	ABCC2	Q92887	1545 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	IQGAP2	Q13576	1575 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	PDPK1	O15530	556 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	GJB6	O95452	261 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	GLB1	P16278	677 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	GBP1	P32455	592 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	SLC6A19	Q695T7	634 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	VHLL	Q6RSH7	139 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	5.91	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM87B	Q96K49	555 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	DISC1	Q9NRI5	854 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		5.9	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089		B2RBV5	119 aa		5.9	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	DNAJA2	O60884	412 aa		5.9	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	ALX3	O95076	343 aa		5.9	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	RAB6A	P20340	208 aa		5.9	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	RING1	Q06587	406 aa		5.9	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	RASA3	Q14644	834 aa		5.9	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		5.9	□□□□□ -1.46

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