RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498007.1

HLA-B-255, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 1,087 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa23.51■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 INCENPQ9NQS7 918 aa23.51■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 USP17L10C9JJH3 530 aa23.5■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 BACE1P56817 501 aa23.5■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 ANKRD23Q86SG2 305 aa23.5■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 ACER1Q8TDN7 264 aa23.5■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 TOMM22Q9NS69 142 aa23.5■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF213O14771 459 aa23.49■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 LBX1P52954 281 aa23.49■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 ATP2B2Q01814 1243 aa23.49■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 PTH1RQ03431 593 aa23.49■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 GPAT2Q6NUI2 795 aa23.49■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 TBC1D10CQ8IV04 446 aa23.49■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 TMOD4Q9NZQ9 345 aa23.49■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 CTNNA3Q9UI47 895 aa23.49■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 TACC3Q9Y6A5 838 aa23.49■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 PDHXO00330 501 aa23.48■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 TSPY3P0CV98 308 aa23.48■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 TSPY8P0CW00 308 aa23.48■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 CRHR2Q13324 411 aa23.48■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 FAM47AQ5JRC9 791 aa23.48■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 TREML2Q5T2D2 321 aa23.48■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 NBPF3Q9H094 633 aa23.48■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 C19orf81C9J6K1 198 aa23.47■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 SH3D19Q5HYK7 790 aa23.47■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa23.47■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa23.47■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa23.47■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa23.47■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 TSPY2A6NKD2 308 aa23.46■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 TFAP4Q01664 338 aa23.46■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 USP17L2Q6R6M4 530 aa23.46■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 PLIN4Q96Q06 1357 aa23.46■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 KANSL2Q9H9L4 492 aa23.46■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 ANO2Q9NQ90 1003 aa23.46■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 NEDD4P46934 1319 aa23.45■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 A0A1W2PRG0 241 aa23.45■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 ORC4O43929 436 aa23.45■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 EEF2P13639 858 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 USP14P54578 494 aa23.45■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 AKNAD1Q5T1N1 836 aa23.45■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 MFSD6Q6ZSS7 791 aa23.45■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 STAG1Q8WVM7 1258 aa23.45■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa23.45■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 SH2D4AQ9H788 454 aa23.45■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa23.45■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 EMILIN3Q9NT22 766 aa23.45■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 MYH4Q9Y623 1939 aa23.45■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 CFHR5Q9BXR6 569 aa23.44■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 CYP2C8P10632 490 aa23.43■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 SIAH1Q8IUQ4 282 aa23.43■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 NEDD1Q8NHV4 660 aa23.43■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 CEP95Q96GE4 821 aa23.43■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa23.42■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 RAD21O60216 631 aa23.42■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 FGRP09769 529 aa23.42■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 PCP11498 1178 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 MAP4K1Q92918 833 aa23.42■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 C12orf42Q96LP6 360 aa23.42■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 PNMA3Q9UL41 463 aa23.42■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa23.42■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 GPR25O00155 361 aa23.41■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 VCAM1P19320 739 aa23.41■■□□□ 1.34
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HLA-B-255ENST00000498007 TMX2Q9Y320 296 aa23.41■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa23.4■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 NMT2O60551 498 aa23.4■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 CYP21A2P08686 494 aa23.4■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 OSBPP22059 807 aa23.4■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 SPICE1Q8N0Z3 855 aa23.4■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 MTMR4Q9NYA4 1195 aa23.4■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 CLIP2Q9UDT6 1046 aa23.4■■□□□ 1.34
HLA-B-255ENST00000498007 TLR2O60603 784 aa23.39■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 TTLL1O95922 423 aa23.39■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 NKX2-3Q8TAU0 364 aa23.39■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 ESR2Q92731 530 aa23.39■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 VCPKMTQ9H867 229 aa23.39■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 GOPCQ9HD26 462 aa23.39■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 NYAP2Q9P242 653 aa23.39■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 CPA4Q9UI42 421 aa23.39■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 STX8Q9UNK0 236 aa23.39■■□□□ 1.33
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