RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493711.1

SNX17-208, Transcript of sorting nexin 17, humanhuman

TSL 3

Gene SNX17, Length 583 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17-208ENST00000493711 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
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SNX17-208ENST00000493711 SEPT2Q15019 361 aa14.58□□□□□ -0.08
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SNX17-208ENST00000493711 CST9Q5W186 159 aa14.58□□□□□ -0.08
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SNX17-208ENST00000493711 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
SNX17-208ENST00000493711 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SNX17-208ENST00000493711 KAT14Q9H8E8 782 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX17-208ENST00000493711 STX8Q9UNK0 236 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX17-208ENST00000493711 MYH1P12882 1939 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX17-208ENST00000493711 CCDC69A6NI79 296 aa14.57□□□□□ -0.08
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