RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	7.81	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	BMP4	P12644	408 aa		7.81	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAP2K3	P46734	347 aa		7.81	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRT76	Q01546	638 aa		7.81	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		7.81	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	LCE2C	Q5TA81	110 aa		7.81	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	7.81	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		7.81	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		7.81	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		7.81	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		7.81	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		7.81	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	TNFRSF25	Q93038	417 aa		7.81	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	7.81	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		7.81	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		7.81	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	7.8	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	NHS	Q6T4R5	1651 aa		7.8	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	MYL6B	P14649	208 aa		7.8	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	7.8	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	NRL	P54845	237 aa		7.8	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPLD1	P80108	840 aa		7.8	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATP2B2	Q01814	1243 aa		7.8	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDE3A	Q14432	1141 aa		7.8	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		7.8	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	COPS6	Q7L5N1	327 aa		7.8	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	7.8	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	SYT9	Q86SS6	491 aa		7.8	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		7.8	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		7.8	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	IRF7	Q92985	503 aa		7.8	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		7.8	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	7.8	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	TJP1	Q07157	1748 aa		7.8	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	PSAP	P07602	524 aa		7.79	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	7.79	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	7.79	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	7.79	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	7.79	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	7.79	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	EP400	Q96L91	3159 aa		7.78	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		7.78	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		7.78	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		7.78	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGKV5-2	P06315	115 aa		7.78	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	CES1	P23141	567 aa		7.78	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	VAMP1	P23763	118 aa		7.78	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	7.78	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	7.78	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLAUR	Q03405	335 aa		7.78	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	7.78	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	BEND3	Q5T5X7	828 aa		7.78	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	7.78	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		7.78	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		7.78	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	7.78	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	7.78	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNF19A	Q9NV58	838 aa		7.78	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	7.78	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		7.78	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	PTPRC	P08575	1304 aa		7.78	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIF16B	Q96L93	1317 aa		7.78	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		7.77	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	DAB2	P98082	770 aa		7.77	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	7.77	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	HLF	Q16534	295 aa		7.77	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	TXNRD1	Q16881	649 aa		7.77	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF827	Q17R98	1081 aa		7.77	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	7.77	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	KSR2	Q6VAB6	950 aa		7.77	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMC4	Q7Z404	712 aa		7.77	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	FRMD6	Q96NE9	622 aa		7.77	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		7.77	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	STK31	Q9BXU1	1019 aa		7.77	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	7.77	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	NPHS2	Q9NP85	383 aa		7.77	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		7.77	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	HYPK	Q9NX55	129 aa		7.77	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		7.77	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	7.77	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	7.77	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		7.77	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	BTAF1	O14981	1849 aa		7.77	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	SBF2	Q86WG5	1849 aa		7.77	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLSCR1	O15162	318 aa		7.76	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	CAMTA2	O94983	1202 aa		7.76	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	APBA3	O96018	575 aa		7.76	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	7.76	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADH6	P28332	368 aa		7.76	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	GNA15	P30679	374 aa		7.76	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	7.76	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	HYAL2	Q12891	473 aa		7.76	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	7.76	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	7.76	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		7.76	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		7.76	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	ILDR2	Q71H61	639 aa		7.76	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		7.76	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		7.76	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	CEP120	Q8N960	986 aa		7.76	□□□□□ -1.17

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