RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486274.5

TBC1D23-208, Transcript of TBC1 domain family member 23, human

TSL 5

Gene TBC1D23, Length 4,054 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBC1D23-208	ENST00000486274	CPD	O75976	1380 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	PSMA7	O14818	248 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	AKR1B10	O60218	316 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	PDE4D	Q08499	809 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	ALAS1	P13196	640 aa		12	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	CASP1	P29466	404 aa		12	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	12	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	SPA17	Q15506	151 aa		12	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	UBXN4	Q92575	508 aa		12	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		12	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		12	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	12	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		12	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	PICK1	Q9NRD5	415 aa		12	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		12	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	CUL4A	Q13619	759 aa		12	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		12	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	TSC1	Q92574	1164 aa		12	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		12	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		12	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	RGS12	O14924	1447 aa		12	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	SSH2	Q76I76	1423 aa		12	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	TRAF5	O00463	557 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	LRMP	Q12912	555 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	CEP135	Q66GS9	1140 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	KIF18A	Q8NI77	898 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	SPAG5	Q96R06	1193 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	ATP10D	Q9P241	1426 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	SCG2	P13521	617 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	UBXN1	Q04323	297 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	PRR16	Q569H4	304 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	SLFN13	Q68D06	897 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	PIGS	Q96S52	555 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	ELP1	O95163	1332 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	ADCY7	P51828	1080 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	VPS72	Q15906	364 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	DPH6	Q7L8W6	267 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	ZMYM6	O95789	1325 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	YEATS4	O95619	227 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	CDC27	P30260	824 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	ERMN	Q8TAM6	284 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	RUFY1	Q96T51	708 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274		H7C1D1	291 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	BLID	Q8IZY5	108 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	JCAD	Q9P266	1359 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	BMP15	O95972	392 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	NCAPD2	Q15021	1401 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	MYL5	Q02045	173 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	DLC1	Q96QB1	1528 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TBC1D23-208	ENST00000486274	UBE2S	Q16763	222 aa		11.97	□□□□□ -0.49

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