RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480416.1

TNS1-215, Transcript of tensin 1, human

TSL 2

Gene TNS1, Length 335 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNS1-215	ENST00000480416	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	LAMB2	P55268	1798 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	GPR37L1	O60883	481 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	MYL6B	P14649	208 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	GRK4	P32298	578 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	ABL2	P42684	1182 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	PHKA2	P46019	1235 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	DCTN1	Q14203	1278 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	MAP3K11	Q16584	847 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	ELP3	Q9H9T3	547 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	GPAM	Q9HCL2	828 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	GABRQ	Q9UN88	632 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	AOX1	Q06278	1338 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	BMP4	P12644	408 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	MSX1	P28360	303 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	NF2	P35240	595 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	PSMC4	P43686	418 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	GSK3A	P49840	483 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	VAC14	Q08AM6	782 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	C4orf17	Q53FE4	359 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	OPTN	Q96CV9	577 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	DEFB118	Q96PH6	123 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	SRRD	Q9UH36	339 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	CPA4	Q9UI42	421 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	LAMB1	P07942	1786 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	BTBD19	C9JJ37	291 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	BACH1	O14867	736 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	OIP5	O43482	229 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	RAD21	O60216	631 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	TLR2	O60603	784 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	ANXA1	P04083	346 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	INHA	P05111	366 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	ELN	P15502	786 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	GDF10	P55107	478 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	PRKCZ	Q05513	592 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	IRF5	Q13568	498 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	CCL15	Q16663	113 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	C17orf99	Q6UX52	265 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	MCM10	Q7L590	875 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	NLRP8	Q86W28	1048 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	RAET1E	Q8TD07	263 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	PPM1E	Q8WY54	764 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	ACD	Q96AP0	544 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		4.33	□□□□□ -1.72
TNS1-215	ENST00000480416	MYPN	Q86TC9	1320 aa		4.33	□□□□□ -1.72
TNS1-215	ENST00000480416	USP17L3	A6NCW0	530 aa		4.33	□□□□□ -1.72
TNS1-215	ENST00000480416	USP17L4	A6NCW7	530 aa		4.33	□□□□□ -1.72
TNS1-215	ENST00000480416	FOSL2	P15408	326 aa		4.33	□□□□□ -1.72

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