RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465122.5

PDCD6IP-208, Transcript of programmed cell death 6 interacting protein, human

TSL 3

Gene PDCD6IP, Length 894 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TMEM253	P0C7T8	217 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	PLCG1	P19174	1290 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TNNI2	P48788	182 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	FAM13C	Q8NE31	585 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	MYLIP	Q8WY64	445 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TSPAN15	O95858	294 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ITGAE	P38570	1179 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	FBLN7	Q53RD9	439 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	MRS2	Q9HD23	443 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	RNF19A	Q9NV58	838 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	DUSP13	Q9UII6	198 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	LTK	P29376	864 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	DAB2	P98082	770 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	LCE1D	Q5T752	114 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	7.24	□□□□□ -1.25	2e-6	■□□□□ 8.1
PDCD6IP-208	ENST00000465122	RELL1	Q8IUW5	271 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	EGR3	Q06889	387 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	OXR1	Q8N573	874 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ESR1	P03372	595 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122		Q96M66	194 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	WASH4P	A8MWX3	477 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	C1QTNF9	P0C862	333 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CFP	P27918	469 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	PWP1	Q13610	501 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	MLEC	Q14165	292 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	PHC3	Q8NDX5	983 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	KCNN1	Q92952	543 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122		F6X3S4	739 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SORBS3	O60504	671 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	HPX	P02790	462 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ERVFC1	P60507	584 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TMC4	Q7Z404	712 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	KLHL3	Q9UH77	587 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	USP31	Q70CQ4	1352 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CILP	O75339	1184 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	PF4	P02776	101 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	GBP1	P32455	592 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	LMNB2	Q03252	620 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	LILRA2	Q8N149	483 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	RNF141	Q8WVD5	230 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CRELD1	Q96HD1	420 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	FAM161B	Q96MY7	647 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	FITM1	A5D6W6	292 aa		7.18	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		7.18	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		7.18	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		7.18	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		7.18	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	GRIN3B	O60391	1043 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	F13A1	P00488	732 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PDCD6IP-208	ENST00000465122	DUSP4	Q13115	394 aa		7.17	□□□□□ -1.26

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