RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461448.5

SNHG12-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 12, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG12, Length 1,629 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12-201ENST00000461448 DOCK1Q14185 1865 aa23.03■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 NMT2O60551 498 aa23.03■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 MCM5P33992 734 aa23.03■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 ICA1Q05084 483 aa23.03■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 PPATQ06203 517 aa23.03■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 GRM1Q13255 1194 aa23.03■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 WNK4Q96J92 1243 aa23.03■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa23.03■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 CASTP20810 708 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 CCDC178Q5BJE1 867 aa23.02■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 CHST3Q7LGC8 479 aa23.02■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 IQCA1Q86XH1 822 aa23.02■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 RASAL3Q86YV0 1011 aa23.02■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 CEP95Q96GE4 821 aa23.02■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa23.02■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa23.01■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 RASSF10A6NK89 507 aa23.01■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 GJA5P36382 358 aa23.01■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 SPP2Q13103 211 aa23.01■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 PPIL2Q13356 520 aa23.01■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 SART3Q15020 963 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa23.01■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 CYP4F22Q6NT55 531 aa23.01■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 CCDC102AQ96A19 550 aa23.01■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 UBAC1Q9BSL1 405 aa23.01■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 MTA3Q9BTC8 594 aa23.01■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 IL17RBQ9NRM6 502 aa23.01■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 MTMR4Q9NYA4 1195 aa23.01■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 PLIN4Q96Q06 1357 aa23.01■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 ATAD5Q96QE3 1844 aa23.01■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 WDR19Q8NEZ3 1342 aa23.01■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 TRIM75PA6NK02 468 aa23■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 EEF2P13639 858 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 RABEP1Q15276 862 aa23■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 SPRYD7Q5W111 196 aa23■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 RUFY3Q7L099 469 aa23■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF280CQ8ND82 737 aa23■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 WDR18Q9BV38 432 aa23■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa23■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa23■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 CLIP2Q9UDT6 1046 aa23■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa23■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 IRF6O14896 467 aa23■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 SLC10A3P09131 477 aa23■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 ACER1Q8TDN7 264 aa23■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 STX8Q9UNK0 236 aa23■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 ERICH2A1L162 156 aa22.99■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 PRC1O43663 620 aa22.99■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 CPA1P15085 419 aa22.99■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.99■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 FEZ1Q99689 392 aa22.99■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 NYAP2Q9P242 653 aa22.99■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 TTLL1O95922 423 aa22.98■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 RPS6KB1P23443 525 aa22.98■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 ECE1P42892 770 aa22.98■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 ANTXR2P58335 489 aa22.98■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 TMEM87BQ96K49 555 aa22.98■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 CAPNS2Q96L46 248 aa22.98■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 TNKSO95271 1327 aa22.97■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 A0A1W2PRG0 241 aa22.97■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 USP17L10C9JJH3 530 aa22.97■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 KIF2CQ99661 725 aa22.97■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 FGD1P98174 961 aa22.97■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 MTMR2Q13614 643 aa22.97■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.97■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.97■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 SH2D4AQ9H788 454 aa22.97■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 CXCL11O14625 94 aa22.96■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 NEK4P51957 841 aa22.96■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 BACE1P56817 501 aa22.96■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 SNAPC2Q13487 334 aa22.96■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 TMEM67Q5HYA8 995 aa22.96■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 TTC14Q96N46 770 aa22.96■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.96■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.27
SNHG12-201ENST00000461448 RAD21O60216 631 aa22.95■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 ST18O60284 1047 aa22.95■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 GTF2A2P52657 109 aa22.95■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.95■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 DGKHQ86XP1 1220 aa22.95■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 TMTC2Q8N394 836 aa22.95■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.95■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 TMX2Q9Y320 296 aa22.95■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 HMGCS2P54868 508 aa22.94■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 WTAPQ15007 396 aa22.94■■□□□ 1.26
SNHG12-201ENST00000461448 ANKRD1Q15327 319 aa22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms