RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 IGHA2P01877 340 aa5.4□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 ADH1AP07327 375 aa5.4□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 VIL1P09327 827 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC19A1P41440 591 aa5.4□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 UBXN2AP68543 259 aa5.4□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 TEFQ10587 303 aa5.4□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 CLN3Q13286 438 aa5.4□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 C16orf46Q6P387 395 aa5.4□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC9A9Q8IVB4 645 aa5.4□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 C7orf61Q8IZ16 206 aa5.4□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 AGBL3Q8NEM8 1001 aa5.4□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 NLRP3Q96P20 1036 aa5.4□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 SAP130Q9H0E3 1048 aa5.4□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa5.4□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 MYOZ2Q9NPC6 264 aa5.4□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 SERTAD1Q9UHV2 236 aa5.4□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM205AQ6ZU69 1335 aa5.4□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 SGPL1O95470 568 aa5.39□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 FOSL2P15408 326 aa5.39□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 MPSTP25325 297 aa5.39□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 MAPK1P28482 360 aa5.39□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 GRK4P32298 578 aa5.39□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 HLFQ16534 295 aa5.39□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 COX20Q5RI15 118 aa5.39□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 TMC4Q7Z404 712 aa5.39□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 RAET1EQ8TD07 263 aa5.39□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 CITED4Q96RK1 184 aa5.39□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa5.39□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP5.39□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 PKD2L1Q9P0L9 805 aa5.39□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 USP3Q9Y6I4 520 aa5.39□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 EML1O00423 815 aa5.38□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 SYN1P17600 705 aa5.38□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 HOXD10P28358 340 aa5.38□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 NNTQ13423 1086 aa5.38□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 TEAD4Q15561 434 aa5.38□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 NECAB2Q7Z6G3 386 aa5.38□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 GIPC2Q8TF65 315 aa5.38□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 MYLIPQ8WY64 445 aa5.38□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 TRIM47Q96LD4 638 aa5.38□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 EYA3Q99504 573 aa5.38□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 PTPN18Q99952 460 aa5.38□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 KCNQ5Q9NR82 932 aa5.38□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 RAB6BQ9NRW1 208 aa5.38□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 STIM2Q9P246 746 aa5.38□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 LRFN2Q9ULH4 789 aa5.38□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa5.38□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 USP16Q9Y5T5 823 aa5.38□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 ERVV-1B6SEH8 477 aa5.37□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 TREHO43280 583 aa5.37□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 FZD6O60353 706 aa5.37□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 TFRCP02786 760 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 GPTP24298 496 aa5.37□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 GRAPQ13588 217 aa5.37□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 TLR1Q15399 786 aa5.37□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 MAP3K11Q16584 847 aa5.37□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 NBPF9Q3BBW0 867 aa5.37□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 SUSD4Q5VX71 490 aa5.37□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 TMC7Q7Z402 723 aa5.37□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa5.37□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa5.37□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 CLMNQ96JQ2 1002 aa5.37□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM129BQ96TA1 746 aa5.37□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa5.37□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 SRRDQ9UH36 339 aa5.37□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 UBN2Q6ZU65 1347 aa5.37□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 BAHCC1Q9P281 2608 aa5.36□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 TLR2O60603 784 aa5.36□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 NTSR2O95665 410 aa5.36□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 PTGIRP43119 386 aa5.36□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 MRE11P49959 708 aa5.36□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 DSC3Q14574 896 aa5.36□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM26DQ5JW98 314 aa5.36□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 TBCELQ5QJ74 424 aa5.36□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 ALKBH2Q6NS38 261 aa5.36□□□□□ -1.55
ECHDC1-211ENST00000460558 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
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