RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417243.5

TRAPPC12-206, Transcript of trafficking protein particle complex 12, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC12, Length 1,047 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12-206ENST00000417243 KANSL2Q9H9L4 492 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 MTMR4Q9NYA4 1195 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 NYAP2Q9P242 653 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 LOC285556D6RIA3 1793 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 ERICH2A1L162 156 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 CPA1P15085 419 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 NEK4P51957 841 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 ICA1Q05084 483 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 VGLL4Q14135 290 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 CST9Q5W186 159 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 LY9Q9HBG7 655 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 PDRG1Q9NUG6 133 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 FZD1Q9UP38 647 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 CEP350Q5VT06 3117 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 ST18O60284 1047 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 TTLL1O95922 423 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 EVCP57679 992 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 SEPT2Q15019 361 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 ANKRD1Q15327 319 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 TMEM67Q5HYA8 995 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 TMTC2Q8N394 836 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 C2orf69Q8N8R5 385 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 ZNF408Q9H9D4 720 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 CSADQ9Y600 493 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 NID2Q14112 1375 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 USP17L5A8MUK1 530 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 NMT2O60551 498 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 PTPRAP18433 802 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 RCAN1P53805 252 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 PRKG1Q13976 671 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 WTAPQ15007 396 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 Q6ZUG5 572 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 CHST3Q7LGC8 479 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 MKL1Q969V6 931 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 TCEANC2Q96MN5 208 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 WDR18Q9BV38 432 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 PICK1Q9NRD5 415 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 SPDYE5A6NIY4 337 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 TOP1P11387 765 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 AK2P54819 239 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 C1QTNF8P60827 252 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 RAB3GAP1Q15042 981 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 MOB2Q70IA6 237 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 CLEC10AQ8IUN9 316 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 SIAH1Q8IUQ4 282 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 LRRC2Q9BYS8 371 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 SH2D4AQ9H788 454 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 AS3MTQ9HBK9 375 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 STX8Q9UNK0 236 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 DDAH1O94760 285 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 EEF2P13639 858 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 MCM2P49736 904 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 PPATQ06203 517 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 ERO1BQ86YB8 467 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 BRF1Q92994 677 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 SNX21Q969T3 373 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 HHIPL1Q96JK4 782 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 TMEM47Q9BQJ4 181 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 TMX2Q9Y320 296 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 TLL2Q9Y6L7 1015 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC12-206ENST00000417243 UBE2Q2LH0YL09 131 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-206ENST00000417243 FGD1P98174 961 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-206ENST00000417243 PPIL2Q13356 520 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-206ENST00000417243 APOA5Q6Q788 366 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-206ENST00000417243 SAPCD2Q86UD0 394 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-206ENST00000417243 ZNF280CQ8ND82 737 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-206ENST00000417243 PNMA1Q8ND90 353 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-206ENST00000417243 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-206ENST00000417243 CLMNQ96JQ2 1002 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-206ENST00000417243 MAP3K14Q99558 947 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-206ENST00000417243 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-206ENST00000417243 KAT14Q9H8E8 782 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-206ENST00000417243 SENP2Q9HC62 589 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-206ENST00000417243 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-206ENST00000417243 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-206ENST00000417243 PARP14Q460N5 1801 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC12-206ENST00000417243 A0A1W2PRG0 241 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC12-206ENST00000417243 CCDC69A6NI79 296 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC12-206ENST00000417243 TMEM88BA6NKF7 163 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC12-206ENST00000417243 SNHG28P0DPA3 235 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC12-206ENST00000417243 USP14P54578 494 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC12-206ENST00000417243 HUNKP57058 714 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC12-206ENST00000417243 TROAPQ12815 778 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC12-206ENST00000417243 ZNF654Q8IZM8 581 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC12-206ENST00000417243 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC12-206ENST00000417243 C12orf42Q96LP6 360 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC12-206ENST00000417243 ELP3Q9H9T3 547 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms