RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384139.1

RNU6-187P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 187, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-187P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-187P-201ENST00000384139 SAMD11Q96NU1 681 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 PCED1AQ9H1Q7 454 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 PLCB3Q01970 1234 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 EGR3Q06889 387 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 PDZD3Q86UT5 571 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF575Q86XF7 245 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 MFSD2AQ8NA29 543 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 C11orf21Q9P2W6 132 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 DUSP13Q9UII6 198 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 VIPR1P32241 457 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 NTF4P34130 210 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZBTB37Q5TC79 503 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 NT5DC1Q5TFE4 455 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 UBE3DQ7Z6J8 389 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF507Q8TCN5 953 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 LOXL4Q96JB6 756 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 C8orf49Q96NF6 230 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMEM39AQ9NV64 488 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 CSADQ9Y600 493 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 CDR1P51861 262 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 LETMD1Q6P1Q0 360 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 CHST13Q8NET6 341 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 GPBAR1Q8TDU6 330 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 NEFLP07196 543 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 MPSTP25325 297 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 LTKP29376 864 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 CNR2P34972 360 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 PURAQ00577 322 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM69CQ0P6D2 419 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAAP100Q0VG06 881 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 GAB4Q2WGN9 574 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 SULF2Q8IWU5 870 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 SHISA4Q96DD7 197 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 ABCB6Q9NP58 842 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 GPATCH2Q9NW75 528 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 PCSK5Q92824 1860 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 DCDC2CA8MYV0 355 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 INHBEP58166 350 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 YBX1P67809 324 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMEM62Q0P6H9 643 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 SIRT2Q8IXJ6 389 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 SEPT3Q9UH03 358 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRAK1Q9UPV9 953 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 FFAR3O14843 346 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 ARNTP27540 789 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 TGFB2P61812 414 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 RING1Q06587 406 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 FLIIQ13045 1269 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 CDCA8Q53HL2 280 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 SPRED1Q7Z699 444 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 C12orf40Q86WS4 652 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP4.02□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 VPS11Q9H270 941 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 CRTAC1Q9NQ79 661 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 CAP2P40123 477 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 GALK1P51570 392 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 NLRX1Q86UT6 975 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 LDHDQ86WU2 507 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 IGDCC3Q8IVU1 814 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 CBX8Q9HC52 389 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 NME2P22392 152 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 ETV3P41162 512 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 GJD3Q8N144 294 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 ELMO3Q96BJ8 720 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 WASH4PA8MWX3 477 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 GJA9P57773 515 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 LIPIQ6XZB0 460 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 DTHD1Q6ZMT9 781 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 STK32AQ8WU08 396 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 SPATA25Q9BR10 227 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF747Q9BV97 191 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 NPHS2Q9NP85 383 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 MPOP05164 745 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 PFKLP17858 780 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-187P-201ENST00000384139 LMO1P25800 156 aa3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms