RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373162.5

TRAPPC3-202, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,056 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-202ENST00000373162 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 RBPJLQ9UBG7 517 aa21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 GJD2Q9UKL4 321 aa21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 PARP14Q460N5 1801 aa21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 ROBO3Q96MS0 1386 aa21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 PEX10O60683 326 aa21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 C16orf86Q6ZW13 317 aa21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 SLAIN1Q8ND83 568 aa21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 RAET1EQ8TD07 263 aa21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 PXYLP1Q8TE99 480 aa21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 APPBP2Q92624 585 aa21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 SWAP70Q9UH65 585 aa21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 GSG1L2A8MUP6 293 aa21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 USP17L12C9JPN9 530 aa21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 USP17L21D6R901 530 aa21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 VCAM1P19320 739 aa21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 RAB3GAP1Q15042 981 aa21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 CTR9Q6PD62 1173 aa21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 LBX2Q6XYB7 198 aa21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 GPATCH3Q96I76 525 aa21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 TMEM106CQ9BVX2 250 aa21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 CNMDO75829 334 aa21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 CABP5Q9NP86 173 aa21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 ADCY3O60266 1144 aa21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 AKR1B1P15121 316 aa21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 CDK8P49336 464 aa21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 USP14P54578 494 aa21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 Q3C1V9 767 aa21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 SBK1Q52WX2 424 aa21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 GIMAP6Q6P9H5 292 aa21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 TMEM179Q6ZVK1 233 aa21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 PCDH10Q9P2E7 1040 aa21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 ELNP15502 786 aa21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 MX1P20591 662 aa21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 USP6NLQ92738 828 aa21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 COA7Q96BR5 231 aa21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 STAP2Q9UGK3 403 aa21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 USP17L15C9J2P7 530 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 USP17L13C9JLJ4 530 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 USP17L11C9JVI0 530 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 USP17L18D6R9N7 530 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 USP17L22D6RA61 530 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 USP17L17D6RBQ6 530 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 USP17L19D6RCP7 530 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 USP17L20D6RJB6 530 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 M0R2C6 588 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 GJB1P08034 283 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 CCL5P13501 91 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 ERVK-9P63128 1117 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 ERVK-24P63145 666 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 USP17L24Q0WX57 530 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 AAMPQ13685 434 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 CLEC10AQ8IUN9 316 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 CCDC17Q96LX7 622 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 FEZ1Q99689 392 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.62■■□□□ 1.055e-6■■■■■ 29.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 PORCNQ9H237 461 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 ERC2O15083 957 aa21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 FOXP2O15409 715 aa21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 GPAA1O43292 621 aa21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 MYCP01106 439 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 INHAP05111 366 aa21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 GJA8P48165 433 aa21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 GCC1Q96CN9 775 aa21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 UNC93B1Q9H1C4 597 aa21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 TMX2Q9Y320 296 aa21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF236Q9UL36 1845 aa21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 CEP290O15078 2479 aa21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 SMC5Q8IY18 1101 aa21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 UBXN2AP68543 259 aa21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 BTBD7Q9P203 1132 aa21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 RASA1P20936 1047 aa21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 MORN1Q5T089 497 aa21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 MAPK4P31152 587 aa21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 PDE1AP54750 535 aa21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 ICA1Q05084 483 aa21.57■■□□□ 1.04
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