RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372292.7

SFTPD-201, Transcript of surfactant protein D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFTPD, Length 1,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPD-201ENST00000372292 ICA1Q05084 483 aa21.5■■□□□ 1.03
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SFTPD-201ENST00000372292 MTMR2Q13614 643 aa21.5■■□□□ 1.03
SFTPD-201ENST00000372292 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SFTPD-201ENST00000372292 AKNAD1Q5T1N1 836 aa21.5■■□□□ 1.03
SFTPD-201ENST00000372292 PTPN18Q99952 460 aa21.5■■□□□ 1.03
SFTPD-201ENST00000372292 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa21.5■■□□□ 1.03
SFTPD-201ENST00000372292 CEP350Q5VT06 3117 aa21.5■■□□□ 1.03
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SFTPD-201ENST00000372292 HMGCS2P54868 508 aa21.49■■□□□ 1.03
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SFTPD-201ENST00000372292 ATP2B2Q01814 1243 aa21.48■■□□□ 1.03
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SFTPD-201ENST00000372292 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
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SFTPD-201ENST00000372292 ESR2Q92731 530 aa21.48■■□□□ 1.03
SFTPD-201ENST00000372292 MAP4K1Q92918 833 aa21.48■■□□□ 1.03
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SFTPD-201ENST00000372292 FOXN1O15353 648 aa21.47■■□□□ 1.03
SFTPD-201ENST00000372292 TBC1D8O95759 1140 aa21.47■■□□□ 1.03
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SFTPD-201ENST00000372292 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.47■■□□□ 1.03
SFTPD-201ENST00000372292 STAG1Q8WVM7 1258 aa21.47■■□□□ 1.03
SFTPD-201ENST00000372292 LPAR1Q92633 364 aa21.47■■□□□ 1.03
SFTPD-201ENST00000372292 GOPCQ9HD26 462 aa21.47■■□□□ 1.03
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SFTPD-201ENST00000372292 GUCY1A2P33402 732 aa21.46■■□□□ 1.03
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SFTPD-201ENST00000372292 TMX2Q9Y320 296 aa21.46■■□□□ 1.03
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SFTPD-201ENST00000372292 LAMB1P07942 1786 aa21.46■■□□□ 1.03
SFTPD-201ENST00000372292 SMIM22K7EJ46 135 aa21.45■■□□□ 1.02
SFTPD-201ENST00000372292 REC8O95072 547 aa21.45■■□□□ 1.02
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SFTPD-201ENST00000372292 USP17L18D6R9N7 530 aa21.44■■□□□ 1.02
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SFTPD-201ENST00000372292 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SFTPD-201ENST00000372292 USP17L24Q0WX57 530 aa21.44■■□□□ 1.02
SFTPD-201ENST00000372292 FAM47AQ5JRC9 791 aa21.44■■□□□ 1.02
SFTPD-201ENST00000372292 GPAT2Q6NUI2 795 aa21.44■■□□□ 1.02
SFTPD-201ENST00000372292 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SFTPD-201ENST00000372292 MTMR4Q9NYA4 1195 aa21.44■■□□□ 1.02
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SFTPD-201ENST00000372292 RAD21O60216 631 aa21.42■■□□□ 1.02
SFTPD-201ENST00000372292 FKTNO75072 461 aa21.42■■□□□ 1.02
SFTPD-201ENST00000372292 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SFTPD-201ENST00000372292 IL25Q9H293 177 aa21.42■■□□□ 1.02
SFTPD-201ENST00000372292 VCPKMTQ9H867 229 aa21.42■■□□□ 1.02
SFTPD-201ENST00000372292 HOXC10Q9NYD6 342 aa21.42■■□□□ 1.02
SFTPD-201ENST00000372292 STX8Q9UNK0 236 aa21.42■■□□□ 1.02
SFTPD-201ENST00000372292 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SFTPD-201ENST00000372292 PLIN4Q96Q06 1357 aa21.41■■□□□ 1.02
SFTPD-201ENST00000372292 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
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