RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa24.98■■□□□ 1.59
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SPHK1-201ENST00000323374 FAM13BQ9NYF5 915 aa24.98■■□□□ 1.59
SPHK1-201ENST00000323374 TUBE1Q9UJT0 475 aa24.98■■□□□ 1.59
SPHK1-201ENST00000323374 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
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SPHK1-201ENST00000323374 KIAA1524Q8TCG1 905 aa24.97■■□□□ 1.59
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SPHK1-201ENST00000323374 KRBA2Q6ZNG9 492 aa24.97■■□□□ 1.59
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SPHK1-201ENST00000323374 KAT14Q9H8E8 782 aa24.97■■□□□ 1.59
SPHK1-201ENST00000323374 MKNK2Q9HBH9 465 aa24.97■■□□□ 1.59
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SPHK1-201ENST00000323374 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
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SPHK1-201ENST00000323374 IL17RBQ9NRM6 502 aa24.94■■□□□ 1.58
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SPHK1-201ENST00000323374 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa24.93■■□□□ 1.58
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SPHK1-201ENST00000323374 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
SPHK1-201ENST00000323374 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa24.93■■□□□ 1.58
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SPHK1-201ENST00000323374 ZNF287Q9HBT7 754 aa24.92■■□□□ 1.58
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SPHK1-201ENST00000323374 C6orf229H3BNL8 230 aa24.91■■□□□ 1.58
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SPHK1-201ENST00000323374 TNFRSF25Q93038 417 aa24.91■■□□□ 1.58
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SPHK1-201ENST00000323374 CCDC144BQ3MJ40 725 aa24.91■■□□□ 1.58
SPHK1-201ENST00000323374 ISM2Q6H9L7 571 aa24.91■■□□□ 1.58
SPHK1-201ENST00000323374 SP8Q8IXZ3 490 aa24.91■■□□□ 1.58
SPHK1-201ENST00000323374 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
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SPHK1-201ENST00000323374 TEX11Q8IYF3 940 aa24.9■■□□□ 1.58
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SPHK1-201ENST00000323374 USP17L4A6NCW7 530 aa24.88■■□□□ 1.57
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SPHK1-201ENST00000323374 OLFM4Q6UX06 510 aa24.88■■□□□ 1.57
SPHK1-201ENST00000323374 USP17L1Q7RTZ2 530 aa24.88■■□□□ 1.57
SPHK1-201ENST00000323374 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
SPHK1-201ENST00000323374 EP400Q96L91 3159 aa24.88■■□□□ 1.57
SPHK1-201ENST00000323374 GRM4Q14833 912 aa24.88■■□□□ 1.57
SPHK1-201ENST00000323374 KANK3Q6NY19 840 aa24.88■■□□□ 1.57
SPHK1-201ENST00000323374 SLC44A5Q8NCS7 719 aa24.88■■□□□ 1.57
SPHK1-201ENST00000323374 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
SPHK1-201ENST00000323374 FERMT2Q96AC1 680 aa24.88■■□□□ 1.57
SPHK1-201ENST00000323374 SERTAD1Q9UHV2 236 aa24.88■■□□□ 1.57
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