RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322054.9

EHD3-201, Transcript of EH domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EHD3, Length 4,636 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3-201ENST00000322054 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa18.13■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa18.13■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 SNAP23O00161 211 aa18.13■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 PPIP5K2O43314 1243 aa18.13■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 HOOK3Q86VS8 718 aa18.13■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 SELENOOQ9BVL4 669 aa18.13■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa18.13■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 INF2Q27J81 1249 aa18.13■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 SLFNL1Q499Z3 407 aa18.13■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 NCAPH2Q6IBW4 605 aa18.13■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 PLVAPQ9BX97 442 aa18.13■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 CETN3O15182 167 aa18.13■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 CFBP00751 764 aa18.13■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 RHOXF2BP0C7M4 288 aa18.13■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 SYNE4Q8N205 404 aa18.13■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP18.13■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 RHOXF2Q9BQY4 288 aa18.13■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa18.13■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 PPP1R9BQ96SB3 815 aa18.12■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 DLGAP5Q15398 846 aa18.12■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP18.12■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 ARHGAP6O43182 974 aa18.12■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 RASGRF1Q13972 1273 aa18.12■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 LCORLQ8N3X6 602 aa18.12■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 RTEL1Q9NZ71 1219 aa18.12■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 CARMIL3Q8ND23 1372 aa18.12■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 IMPG2Q9BZV3 1241 aa18.11■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 RGS22Q8NE09 1264 aa18.11■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 NF2P35240 595 aa18.11■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 PDE6BP35913 854 aa18.11■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 NELFBQ8WX92 580 aa18.11■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 CLEC11AQ9Y240 323 aa18.11■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 TRIM14Q14142 442 aa18.11■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 TBC1D7Q9P0N9 293 aa18.11■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 EVCP57679 992 aa18.1■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 LRMPQ12912 555 aa18.1■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 KRBA2Q6ZNG9 492 aa18.1■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 SLC39A14Q15043 492 aa18.1■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 LEMD3Q9Y2U8 911 aa18.1■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 XDHP47989 1333 aa18.1■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 B4DLN1 442 aa18.1■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 SEMA3EO15041 775 aa18.1■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 PCP11498 1178 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 PTGDRQ13258 359 aa18.1■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 LMBR1Q8WVP7 490 aa18.1■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 ZSWIM5Q9P217 1185 aa18.1■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 GPIHBP1Q8IV16 184 aa18.1■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 SUPT20HQ8NEM7 779 aa18.1■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa18.1■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 NSMFQ6X4W1 530 aa18.09■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 NLGN1Q8N2Q7 840 aa18.09■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 FAM212AQ96EL1 285 aa18.09■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 A0A1W2PQ27 194 aa18.09■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 A0A1W2PQ64 194 aa18.09■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 A0A1W2PQD8 194 aa18.09■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 FSD2A1L4K1 749 aa18.09■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 EPB41P11171 864 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa18.09■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 NELFCDQ8IXH7 590 aa18.09■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 DNM3Q9UQ16 869 aa18.09■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 PTPRMP28827 1452 aa18.09■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 DDAH1O94760 285 aa18.09■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 MYZAPP0CAP1 466 aa18.09■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 MCAMP43121 646 aa18.09■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 ERO1AQ96HE7 468 aa18.09■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 TRERF1Q96PN7 1200 aa18.09■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 SYNCQ9H7C4 482 aa18.09■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa18.09■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 ARHGEF35A5YM69 484 aa18.08■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 SERPINB2P05120 415 aa18.08■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 RCOR1Q9UKL0 485 aa18.08■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 HSF2BPO75031 334 aa18.08■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
EHD3-201ENST00000322054 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 CYP26C1Q6V0L0 522 aa18.08■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 TMTC1Q8IUR5 882 aa18.08■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 CARD6Q9BX69 1037 aa18.08■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 PICK1Q9NRD5 415 aa18.08■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 PRPHP41219 470 aa18.08■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 FANCLQ9NW38 375 aa18.08■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 PALLDQ8WX93 1383 aa18.08■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa18.07■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 MAEAQ7L5Y9 396 aa18.07■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 AIFM3Q96NN9 605 aa18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms