RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 ADM5C9JUS6 153 aa25.93■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 ZBTB43O43298 467 aa25.93■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 TMEM179Q6ZVK1 233 aa25.93■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 CABP5Q9NP86 173 aa25.93■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 FOXD4L1Q9NU39 408 aa25.93■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 CLEC11AQ9Y240 323 aa25.93■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 CCT2P78371 535 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa25.92■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 GTF3C6Q969F1 213 aa25.92■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 KAT14Q9H8E8 782 aa25.92■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 MTMR4Q9NYA4 1195 aa25.92■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 NOVP48745 357 aa25.91■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 SCRN1Q12765 414 aa25.91■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 CATIPQ7Z7H3 387 aa25.91■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 USP48Q86UV5 1035 aa25.91■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 MICU3Q86XE3 530 aa25.91■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 ZNF654Q8IZM8 581 aa25.91■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 HPS5Q9UPZ3 1129 aa25.91■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 PHF20L1A8MW92 1017 aa25.9■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 GH2P01242 217 aa25.9■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 ST3GAL1Q11201 340 aa25.9■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa25.9■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 TMEM47Q9BQJ4 181 aa25.9■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 MYL10Q9BUA6 226 aa25.9■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 ZNF341Q9BYN7 854 aa25.9■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 RXRAP19793 462 aa25.9■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 CAP2P40123 477 aa25.9■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP25.9■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 JAG1P78504 1218 aa25.9■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 SEPT2Q15019 361 aa25.9■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 DLK2Q6UY11 383 aa25.9■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 CDC37L1Q7L3B6 337 aa25.9■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 KANSL2Q9H9L4 492 aa25.9■■□□□ 1.74
CTU2-201ENST00000312060 TTLL1O95922 423 aa25.89■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 POTEIP0CG38 1075 aa25.89■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 POTEJP0CG39 1038 aa25.89■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 RAB3GAP1Q15042 981 aa25.89■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 NUP133Q8WUM0 1156 aa25.89■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 NMRK2Q9NPI5 230 aa25.89■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 TOP1P11387 765 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 GUCY1A2P33402 732 aa25.88■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 RCAN1P53805 252 aa25.88■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 CLEC10AQ8IUN9 316 aa25.88■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 PNMA1Q8ND90 353 aa25.88■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 CHMP4CQ96CF2 233 aa25.88■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 CLIP2Q9UDT6 1046 aa25.88■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 TROAPQ12815 778 aa25.87■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa25.87■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa25.87■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 SSC5DA1L4H1 1573 aa25.87■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 GOLGA8AA7E2F4 631 aa25.87■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 DDAH1O94760 285 aa25.87■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 CALM1P0DP23 149 aa25.87■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 CALM2P0DP24 149 aa25.87■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 CALM3P0DP25 149 aa25.87■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 ATP2B2Q01814 1243 aa25.87■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 ICA1Q05084 483 aa25.86■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 CDCA5Q96FF9 252 aa25.86■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 NYAP2Q9P242 653 aa25.86■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 ZNF112Q9UJU3 913 aa25.86■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 ASNSP08243 561 aa25.85■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 EEF2P13639 858 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 FANCBQ8NB91 859 aa25.85■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 FZD1Q9UP38 647 aa25.85■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 DOCK1Q14185 1865 aa25.85■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 ADD1P35611 737 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 RTN1Q16799 776 aa25.84■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 LDHDQ86WU2 507 aa25.84■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 NID2Q14112 1375 aa25.84■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 CPLX1O14810 134 aa25.83■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 CDC27P30260 824 aa25.83■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 INPP5BP32019 993 aa25.83■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 NF2P35240 595 aa25.83■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 PRKG1Q13976 671 aa25.83■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 PPP2R5BQ15173 497 aa25.83■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 SIAH1Q8IUQ4 282 aa25.83■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 MKL1Q969V6 931 aa25.83■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 KLRG1Q96E93 195 aa25.83■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 WRNIP1Q96S55 665 aa25.83■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 GINM1Q9NU53 330 aa25.83■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 SMC3Q9UQE7 1217 aa25.83■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa25.83■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 MTMR7Q9Y216 660 aa25.83■■□□□ 1.73
CTU2-201ENST00000312060 DTNBO60941 627 aa25.82■■□□□ 1.72
CTU2-201ENST00000312060 USP2O75604 605 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
CTU2-201ENST00000312060 MAP3K14Q99558 947 aa25.82■■□□□ 1.72
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