RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 SEC24BO95487 1268 aa21.76■■□□□ 1.07
PTX4-201ENST00000293922 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
PTX4-201ENST00000293922 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
PTX4-201ENST00000293922 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa21.76■■□□□ 1.07
PTX4-201ENST00000293922 USP17L10C9JJH3 530 aa21.75■■□□□ 1.07
PTX4-201ENST00000293922 CYP2D6P10635 497 aa21.75■■□□□ 1.07
PTX4-201ENST00000293922 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
PTX4-201ENST00000293922 PNMA3Q9UL41 463 aa21.75■■□□□ 1.07
PTX4-201ENST00000293922 CCDC171Q6TFL3 1326 aa21.75■■□□□ 1.07
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PTX4-201ENST00000293922 REC8O95072 547 aa21.74■■□□□ 1.07
PTX4-201ENST00000293922 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
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PTX4-201ENST00000293922 SRRDQ9UH36 339 aa21.74■■□□□ 1.07
PTX4-201ENST00000293922 C19orf81C9J6K1 198 aa21.73■■□□□ 1.07
PTX4-201ENST00000293922 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
PTX4-201ENST00000293922 OSBPP22059 807 aa21.73■■□□□ 1.07
PTX4-201ENST00000293922 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
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PTX4-201ENST00000293922 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa21.72■■□□□ 1.07
PTX4-201ENST00000293922 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa21.72■■□□□ 1.07
PTX4-201ENST00000293922 ZNF333Q96JL9 665 aa21.72■■□□□ 1.07
PTX4-201ENST00000293922 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
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PTX4-201ENST00000293922 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21.72■■□□□ 1.07
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PTX4-201ENST00000293922 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa21.72■■□□□ 1.07
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PTX4-201ENST00000293922 FAM110CQ1W6H9 321 aa21.71■■□□□ 1.07
PTX4-201ENST00000293922 C12orf60Q5U649 245 aa21.71■■□□□ 1.07
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PTX4-201ENST00000293922 USP17L12C9JPN9 530 aa21.7■■□□□ 1.06
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PTX4-201ENST00000293922 USP17L2Q6R6M4 530 aa21.69■■□□□ 1.06
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PTX4-201ENST00000293922 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa21.68■■□□□ 1.06
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PTX4-201ENST00000293922 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
PTX4-201ENST00000293922 TXNRD2Q9NNW7 524 aa21.64■■□□□ 1.06
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