RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 NBPF9Q3BBW0 867 aa23.54■■□□□ 1.36
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC183Q5T5S1 534 aa23.54■■□□□ 1.36
UBE2B-201ENST00000265339 C16orf86Q6ZW13 317 aa23.54■■□□□ 1.36
UBE2B-201ENST00000265339 TTC6Q86TZ1 520 aa23.54■■□□□ 1.36
UBE2B-201ENST00000265339 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa23.54■■□□□ 1.36
UBE2B-201ENST00000265339 SPC24Q8NBT2 197 aa23.53■■□□□ 1.36
UBE2B-201ENST00000265339 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa23.53■■□□□ 1.36
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM87BQ96K49 555 aa23.53■■□□□ 1.36
UBE2B-201ENST00000265339 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
UBE2B-201ENST00000265339 TMOD2Q9NZR1 351 aa23.53■■□□□ 1.36
UBE2B-201ENST00000265339 CNPY2Q9Y2B0 182 aa23.53■■□□□ 1.36
UBE2B-201ENST00000265339 ST3GAL1Q11201 340 aa23.53■■□□□ 1.36
UBE2B-201ENST00000265339 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
UBE2B-201ENST00000265339 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
UBE2B-201ENST00000265339 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa23.52■■□□□ 1.36
UBE2B-201ENST00000265339 SAMD7Q7Z3H4 446 aa23.52■■□□□ 1.36
UBE2B-201ENST00000265339 SENP2Q9HC62 589 aa23.52■■□□□ 1.36
UBE2B-201ENST00000265339 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 TCP10L2B9ZVM9 353 aa23.52■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 ENTPD3O75355 529 aa23.52■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 CDK8P49336 464 aa23.52■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 GABPAQ06546 454 aa23.52■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 FAM47AQ5JRC9 791 aa23.52■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 PLCD3Q8N3E9 789 aa23.52■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 NECAB1Q8N987 351 aa23.52■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM67Q5HYA8 995 aa23.51■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 LY9Q9HBG7 655 aa23.51■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 MKNK2Q9HBH9 465 aa23.51■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 SLFN14P0C7P3 912 aa23.51■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 STK3Q13188 491 aa23.51■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 VEZTQ9HBM0 779 aa23.51■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 GPRC5DQ9NZD1 345 aa23.51■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 MYO1BO43795 1136 aa23.5■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 HLA-DOAP06340 250 aa23.5■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 EVCP57679 992 aa23.5■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC83Q8IWF9 413 aa23.5■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 CNTNAP1P78357 1384 aa23.5■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 ATRNL1Q5VV63 1379 aa23.5■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 DDNO94850 711 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 RASA1P20936 1047 aa23.5■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 UBAC1Q9BSL1 405 aa23.5■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 SERPINB13Q9UIV8 391 aa23.5■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 MYH8P13535 1937 aa23.49■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 GRIN3BO60391 1043 aa23.49■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 TNKSO95271 1327 aa23.49■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 TSPY2A6NKD2 308 aa23.49■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 DTNBO60941 627 aa23.49■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 SART3Q15020 963 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa23.49■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 MTA3Q9BTC8 594 aa23.49■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF287Q9HBT7 754 aa23.49■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa23.48■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 AP5Z1O43299 807 aa23.48■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 SLURP2P0DP57 97 aa23.48■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 EHD4Q9H223 541 aa23.48■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 TCHHQ07283 1943 aa23.48■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 NMT2O60551 498 aa23.48■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 SYT1P21579 422 aa23.48■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 SEC23AQ15436 765 aa23.48■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 FKBP1CQ5VVH2 108 aa23.48■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM87AQ8NBN3 555 aa23.48■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 H7C1D1 291 aa23.47■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 TPM3P06753 285 aa23.47■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 LIFRP42702 1097 aa23.47■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 TFAP4Q01664 338 aa23.47■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 SGMS1Q86VZ5 419 aa23.47■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 IQCA1Q86XH1 822 aa23.47■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 GTF3C6Q969F1 213 aa23.47■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 ERICH2A1L162 156 aa23.47■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 STX6O43752 255 aa23.47■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 WTAPQ15007 396 aa23.47■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 DNAJC18Q9H819 358 aa23.47■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 PI4KBQ9UBF8 816 aa23.47■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 PFKFB2O60825 505 aa23.46■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 EPS15P42566 896 aa23.46■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 NT5C2P49902 561 aa23.46■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 SCRN1Q12765 414 aa23.46■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 TRPM4Q8TD43 1214 aa23.46■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 FAM151AQ8WW52 585 aa23.46■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC66A2RUB6 948 aa23.46■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 GOLGA8BA8MQT2 603 aa23.46■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 FIBPO43427 364 aa23.46■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 SWAP70Q9UH65 585 aa23.46■■□□□ 1.35
UBE2B-201ENST00000265339 TSPY3P0CV98 308 aa23.45■■□□□ 1.34
UBE2B-201ENST00000265339 TSPY8P0CW00 308 aa23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.6 ms