RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 EMILIN3Q9NT22 766 aa26.58■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PRG0 241 aa26.57■■□□□ 1.84
SYF2-201ENST00000236273 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
SYF2-201ENST00000236273 CTDSPL2Q05D32 466 aa26.57■■□□□ 1.84
SYF2-201ENST00000236273 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
SYF2-201ENST00000236273 INCENPQ9NQS7 918 aa26.57■■□□□ 1.84
SYF2-201ENST00000236273 ZMYM6O95789 1325 aa26.57■■□□□ 1.84
SYF2-201ENST00000236273 ADGRA2Q96PE1 1338 aa26.57■■□□□ 1.84
SYF2-201ENST00000236273 C19orf81C9J6K1 198 aa26.56■■□□□ 1.84
SYF2-201ENST00000236273 PRDM1O75626 825 aa26.56■■□□□ 1.84
SYF2-201ENST00000236273 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
SYF2-201ENST00000236273 CLEC10AQ8IUN9 316 aa26.56■■□□□ 1.84
SYF2-201ENST00000236273 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa26.56■■□□□ 1.84
SYF2-201ENST00000236273 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa26.56■■□□□ 1.84
SYF2-201ENST00000236273 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP26.56■■□□□ 1.84
SYF2-201ENST00000236273 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa26.56■■□□□ 1.84
SYF2-201ENST00000236273 TLR2O60603 784 aa26.55■■□□□ 1.84
SYF2-201ENST00000236273 FGRP09769 529 aa26.55■■□□□ 1.84
SYF2-201ENST00000236273 BMP2KLQ5H9B9 411 aa26.55■■□□□ 1.84
SYF2-201ENST00000236273 MKNK2Q9HBH9 465 aa26.55■■□□□ 1.84
SYF2-201ENST00000236273 CYP2C8P10632 490 aa26.54■■□□□ 1.84
SYF2-201ENST00000236273 NBPF3Q9H094 633 aa26.54■■□□□ 1.84
SYF2-201ENST00000236273 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa26.54■■□□□ 1.84
SYF2-201ENST00000236273 CAP1Q01518 475 aa26.53■■□□□ 1.84
SYF2-201ENST00000236273 C17orf99Q6UX52 265 aa26.53■■□□□ 1.84
SYF2-201ENST00000236273 C12orf42Q96LP6 360 aa26.53■■□□□ 1.84
SYF2-201ENST00000236273 DSCC1Q9BVC3 393 aa26.53■■□□□ 1.84
SYF2-201ENST00000236273 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa26.52■■□□□ 1.84
SYF2-201ENST00000236273 USP17L2Q6R6M4 530 aa26.52■■□□□ 1.84
SYF2-201ENST00000236273 RAD50Q92878 1312 aa26.52■■□□□ 1.84
SYF2-201ENST00000236273 SGSM2O43147 1006 aa26.51■■□□□ 1.83
SYF2-201ENST00000236273 FKTNO75072 461 aa26.51■■□□□ 1.83
SYF2-201ENST00000236273 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa26.51■■□□□ 1.83
SYF2-201ENST00000236273 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
SYF2-201ENST00000236273 PDE4BQ07343 736 aa26.5■■□□□ 1.83
SYF2-201ENST00000236273 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
SYF2-201ENST00000236273 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
SYF2-201ENST00000236273 NKX2-3Q8TAU0 364 aa26.5■■□□□ 1.83
SYF2-201ENST00000236273 KANSL2Q9H9L4 492 aa26.5■■□□□ 1.83
SYF2-201ENST00000236273 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
SYF2-201ENST00000236273 EEF2P13639 858 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
SYF2-201ENST00000236273 HAND2P61296 217 aa26.49■■□□□ 1.83
SYF2-201ENST00000236273 PTH1RQ03431 593 aa26.49■■□□□ 1.83
SYF2-201ENST00000236273 ICA1Q05084 483 aa26.49■■□□□ 1.83
SYF2-201ENST00000236273 RUFY2Q8WXA3 655 aa26.49■■□□□ 1.83
SYF2-201ENST00000236273 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
SYF2-201ENST00000236273 ZNF287Q9HBT7 754 aa26.49■■□□□ 1.83
SYF2-201ENST00000236273 TMOD4Q9NZQ9 345 aa26.49■■□□□ 1.83
SYF2-201ENST00000236273 TMX2Q9Y320 296 aa26.49■■□□□ 1.83
SYF2-201ENST00000236273 SP3Q02447 781 aa26.48■■□□□ 1.83
SYF2-201ENST00000236273 FAM47AQ5JRC9 791 aa26.48■■□□□ 1.83
SYF2-201ENST00000236273 NEDD1Q8NHV4 660 aa26.48■■□□□ 1.83
SYF2-201ENST00000236273 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
SYF2-201ENST00000236273 CPA4Q9UI42 421 aa26.48■■□□□ 1.83
SYF2-201ENST00000236273 PLIN4Q96Q06 1357 aa26.47■■□□□ 1.83
SYF2-201ENST00000236273 ORC4O43929 436 aa26.47■■□□□ 1.83
SYF2-201ENST00000236273 BCRP11274 1271 aa26.47■■□□□ 1.83
SYF2-201ENST00000236273 USP14P54578 494 aa26.47■■□□□ 1.83
SYF2-201ENST00000236273 POTEEQ6S8J3 1075 aa26.47■■□□□ 1.83
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D10CQ8IV04 446 aa26.47■■□□□ 1.83
SYF2-201ENST00000236273 FEZ1Q99689 392 aa26.47■■□□□ 1.83
SYF2-201ENST00000236273 TFAP4Q01664 338 aa26.46■■□□□ 1.83
SYF2-201ENST00000236273 NYAP2Q9P242 653 aa26.46■■□□□ 1.83
SYF2-201ENST00000236273 VCAM1P19320 739 aa26.45■■□□□ 1.83
SYF2-201ENST00000236273 CEP95Q96GE4 821 aa26.45■■□□□ 1.83
SYF2-201ENST00000236273 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
SYF2-201ENST00000236273 IL17RBQ9NRM6 502 aa26.45■■□□□ 1.83
SYF2-201ENST00000236273 MTMR4Q9NYA4 1195 aa26.45■■□□□ 1.83
SYF2-201ENST00000236273 LAMA4Q16363 1823 aa26.45■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP26.44■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 AKNAD1Q5T1N1 836 aa26.44■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa26.44■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 CD99L2Q8TCZ2 262 aa26.44■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 STAG1Q8WVM7 1258 aa26.44■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 VCPKMTQ9H867 229 aa26.44■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa26.44■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 ZNF213O14771 459 aa26.43■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 TSPY3P0CV98 308 aa26.43■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 TSPY8P0CW00 308 aa26.43■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 OSBPP22059 807 aa26.43■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 CTGFP29279 349 aa26.43■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 MKL1Q969V6 931 aa26.43■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa26.43■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 PNMA3Q9UL41 463 aa26.43■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 NOVP48745 357 aa26.42■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 MAP4K1Q92918 833 aa26.42■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa26.42■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa26.42■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 USP17L15C9J2P7 530 aa26.41■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 USP17L13C9JLJ4 530 aa26.41■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 USP17L11C9JVI0 530 aa26.41■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 USP17L18D6R9N7 530 aa26.41■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 USP17L22D6RA61 530 aa26.41■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 USP17L17D6RBQ6 530 aa26.41■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 USP17L19D6RCP7 530 aa26.41■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 USP17L20D6RJB6 530 aa26.41■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 NMT2O60551 498 aa26.41■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 ATP2B2Q01814 1243 aa26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms