RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000196489.3

ZNF416-201, Transcript of zinc finger protein 416, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF416, Length 2,561 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF416-201ENST00000196489 SCN7AQ01118 1682 aa20.54■□□□□ 0.88
ZNF416-201ENST00000196489 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
ZNF416-201ENST00000196489 AFMP43652 599 aa20.53■□□□□ 0.88
ZNF416-201ENST00000196489 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
ZNF416-201ENST00000196489 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.88
ZNF416-201ENST00000196489 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
ZNF416-201ENST00000196489 V9GYY5 206 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
ZNF416-201ENST00000196489 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
ZNF416-201ENST00000196489 TMTC3Q6ZXV5 915 aa20.53■□□□□ 0.88
ZNF416-201ENST00000196489 ANKRD7Q92527 254 aa20.53■□□□□ 0.88
ZNF416-201ENST00000196489 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa20.53■□□□□ 0.88
ZNF416-201ENST00000196489 NYXQ9GZU5 481 aa20.53■□□□□ 0.88
ZNF416-201ENST00000196489 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.88
ZNF416-201ENST00000196489 ADAMTS3O15072 1205 aa20.52■□□□□ 0.88
ZNF416-201ENST00000196489 INTS13Q9NVM9 706 aa20.52■□□□□ 0.88
ZNF416-201ENST00000196489 RPS6KA4O75676 772 aa20.52■□□□□ 0.88
ZNF416-201ENST00000196489 USP17L8P0C7I0 530 aa20.52■□□□□ 0.88
ZNF416-201ENST00000196489 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
ZNF416-201ENST00000196489 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
ZNF416-201ENST00000196489 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
ZNF416-201ENST00000196489 MYH6P13533 1939 aa20.52■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 MCM9Q9NXL9 1143 aa20.51■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa20.51■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa20.51■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.51■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 TSPY2A6NKD2 308 aa20.51■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 CBFA2T2O43439 604 aa20.51■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 FGRP09769 529 aa20.51■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 SEMA3EO15041 775 aa20.5■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 MORC3Q14149 939 aa20.5■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 PPP2R5BQ15173 497 aa20.5■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 NPY5RQ15761 445 aa20.5■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 TPTE2Q6XPS3 522 aa20.5■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 TOP1P11387 765 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 SARSP49591 514 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 VSTM4Q8IW00 320 aa20.5■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 STAMQ92783 540 aa20.5■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 MED15Q96RN5 788 aa20.5■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 ANKRD2Q9GZV1 360 aa20.5■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 MTMR7Q9Y216 660 aa20.5■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 DDAH1O94760 285 aa20.49■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 CALM1P0DP23 149 aa20.49■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 CALM2P0DP24 149 aa20.49■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 CALM3P0DP25 149 aa20.49■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 TM4SF1P30408 202 aa20.49■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 SYT10Q6XYQ8 523 aa20.49■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 DYNLL2Q96FJ2 89 aa20.49■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa20.49■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 VWA3AA6NCI4 1184 aa20.48■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 ORC4O43929 436 aa20.48■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 TTC38Q5R3I4 469 aa20.48■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 KLHL10Q6JEL2 608 aa20.48■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa20.48■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 KIF18AQ8NI77 898 aa20.48■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 SPDYE4A6NLX3 237 aa20.48■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 NLRP5P59047 1200 aa20.48■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 GRIK5Q16478 980 aa20.48■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 NT5DC1Q5TFE4 455 aa20.48■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 TNFRSF25Q93038 417 aa20.48■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.48■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 STX17P56962 302 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 CBX1P83916 185 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 KCND1Q9NSA2 647 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 LTBP4Q8N2S1 1624 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 NRDCO43847 1150 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 COBLO75128 1261 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 PTGDRQ13258 359 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 DIXDC1Q155Q3 683 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 MLKLQ8NB16 471 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 PCP11498 1178 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 PAGE5Q96GU1 130 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 USP5P45974 858 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 TFAP4Q01664 338 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 NFIXQ14938 502 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 VPS72Q15906 364 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
ZNF416-201ENST00000196489 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ZNF416-201ENST00000196489 SCG2P13521 617 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF416-201ENST00000196489 MCM7P33993 719 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF416-201ENST00000196489 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
ZNF416-201ENST00000196489 RCSD1Q6JBY9 416 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF416-201ENST00000196489 KANK3Q6NY19 840 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF416-201ENST00000196489 HOMER1Q86YM7 354 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF416-201ENST00000196489 PRDM10Q9NQV6 1147 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms