RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000107060.7

Eftud2-202, Transcript of 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Eftud2, Length 3,339 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm45140A0A0N4SUM8 220 aa17.1■□□□□ 0.33
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lrrc15Q80X72 579 aa17.1■□□□□ 0.33
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ctdspl2Q8BG15 465 aa17.1■□□□□ 0.33
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lrrd1Q8C0R9 853 aa17.1■□□□□ 0.33
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rbm28Q8CGC6 750 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Jag1Q9QXX0 1218 aa17.1■□□□□ 0.33
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CluhQ5SW19 1315 aa17.1■□□□□ 0.33
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm973E9Q295 1059 aa17.1■□□□□ 0.33
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ppef2O35385 757 aa17.1■□□□□ 0.33
Eftud2-202ENSMUST00000107060 PRAG1Q571I4 1179 aa17.1■□□□□ 0.33
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Luc7l2Q7TNC4 392 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Calml3Q9D6P8 149 aa17.1■□□□□ 0.33
Eftud2-202ENSMUST00000107060 1810065E05RikQ5NC41 235 aa17.09■□□□□ 0.33
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Triml1Q8BVP1 470 aa17.09■□□□□ 0.33
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Polr2dQ9D7M8 142 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
Eftud2-202ENSMUST00000107060 MeiocA2AG06 965 aa17.09■□□□□ 0.33
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cep85Q8BMK0 761 aa17.09■□□□□ 0.33
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Stac3Q8BZ71 360 aa17.09■□□□□ 0.33
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Myl3P09542 204 aa17.09■□□□□ 0.33
Eftud2-202ENSMUST00000107060 PsdQ5DTT2 1024 aa17.09■□□□□ 0.33
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tekt3Q6X6Z7 490 aa17.09■□□□□ 0.33
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gga3Q8BMI3 718 aa17.09■□□□□ 0.33
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Apobec3Q99J72 440 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
Eftud2-202ENSMUST00000107060 HibadhQ99L13 335 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mrps25Q9D125 171 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Myo19Q5SV80 963 aa17.08■□□□□ 0.33
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ift122Q6NWV3 1182 aa17.08■□□□□ 0.33
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Atp12aQ9Z1W8 1035 aa17.08■□□□□ 0.33
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pdia4P08003 638 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Usp53P15975 1069 aa17.08■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sned1Q70E20 1403 aa17.08■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pramel6Q810Y9 485 aa17.08■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mtcl1Q3UHU5 1945 aa17.08■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tex13cD3YU32 604 aa17.08■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Stag2O35638 1231 aa17.08■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rad23bP54728 416 aa17.08■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gjb4Q02738 266 aa17.08■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Prpf38aQ4FK66 312 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Asnsd1Q8BFS9 627 aa17.08■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nup133Q8R0G9 1155 aa17.08■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tubgcp2Q921G8 905 aa17.08■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zfp853A0A1D5RM95 733 aa17.07■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 LtkP08923 888 aa17.07■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 RdxP26043 583 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Aco1P28271 889 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 MycbpapQ5SUV2 932 aa17.07■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 E2f4Q8R0K9 410 aa17.07■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lmbr1Q9JIT0 490 aa17.07■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Irx4Q9QY61 515 aa17.07■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 DnttP09838 530 aa17.07■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pde5aQ8CG03 865 aa17.07■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Grpel1Q99LP6 217 aa17.07■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Scrn1Q9CZC8 414 aa17.07■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Btn2a2A4QPC6 514 aa17.06■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hdac4Q6NZM9 1076 aa17.06■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 DaglaQ6WQJ1 1044 aa17.06■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Myl6bQ8CI43 207 aa17.06■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rasa2P58069 847 aa17.06■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 EgfrQ01279 1210 aa17.06■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cdc37Q61081 379 aa17.06■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pim2Q62070 370 aa17.06■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccdc94Q9D6J3 314 aa17.06■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tmem47Q9JJG6 181 aa17.06■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Psmd10Q9Z2X2 231 aa17.06■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 GnaqP21279 359 aa17.06■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nell2Q61220 819 aa17.06■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tm4sf1Q64302 202 aa17.06■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Enox1Q8BHR2 643 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cd2apQ9JLQ0 637 aa17.06■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dhx8A2A4P0 1244 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Stx8O88983 236 aa17.05■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 MarcksP26645 309 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 NppbP40753 121 aa17.05■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cdkn1cP49919 348 aa17.05■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pex1Q5BL07 1284 aa17.05■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tmem60Q8K174 133 aa17.05■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Iqca1Q9CUL5 857 aa17.05■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zbed3Q9D0L1 228 aa17.05■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cyp26c1B2RXA7 518 aa17.05■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm5624F6ZZG8 207 aa17.05■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fhdc1Q3ULZ2 1149 aa17.05■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Larp6Q8BN59 492 aa17.05■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cdk8Q8R3L8 464 aa17.05■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 C87499Q3UX49 493 aa17.04■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Adck2Q6NSR3 617 aa17.04■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Frmpd4A2AFR3 1320 aa17.04■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gucy1a2F8VQK3 730 aa17.04■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rc3h1Q4VGL6 1130 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Epha10Q8BYG9 1007 aa17.04■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lzts2Q91YU6 671 aa17.04■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Clip2Q9Z0H8 1047 aa17.04■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Api5O35841 504 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ms4a1P19437 291 aa17.04■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cep128Q8BI22 1102 aa17.04■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fam186bD3Z420 943 aa17.03■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 LRWD1Q8BUI3 648 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ubxn8Q9QZ49 277 aa17.03■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Plxnb2B2RXS4 1842 aa17.03■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Grem2O88273 168 aa17.03■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cdh15P33146 784 aa17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11.7 ms