RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000172142.7

Nisch-222, Transcript of Nischarin, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nisch, Length 2,780 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nisch-222ENSMUST00000172142 Krtap19-4Q925H7 84 aa7.38□□□□□ -1.23
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm38119A0A0A6YX29 146 aa7.34□□□□□ -1.23
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm10142J3KMP7 120 aa7.3□□□□□ -1.24
Nisch-222ENSMUST00000172142 Lce1fB9EJP6 147 aa7.29□□□□□ -1.24
Nisch-222ENSMUST00000172142 Lce1a1Q9CQH5 143 aa7.29□□□□□ -1.24
Nisch-222ENSMUST00000172142 Krtap4-13Q9D7P3 165 aa7.28□□□□□ -1.24
Nisch-222ENSMUST00000172142 Syne1Q6ZWR6 8799 aa7.19□□□□□ -1.26
Nisch-222ENSMUST00000172142 Lce1bQ9D149 137 aa7.15□□□□□ -1.26
Nisch-222ENSMUST00000172142 2300003K06RikA2A4M0 262 aa7.1□□□□□ -1.27
Nisch-222ENSMUST00000172142 Lce3cQ91V05 98 aa7.1□□□□□ -1.27
Nisch-222ENSMUST00000172142 Sprr2iO70560 76 aa7.09□□□□□ -1.27
Nisch-222ENSMUST00000172142 Lce3dE9Q8V1 98 aa7.04□□□□□ -1.28
Nisch-222ENSMUST00000172142 Sprr2kO70562 68 aa7.03□□□□□ -1.28
Nisch-222ENSMUST00000172142 Sprr2hO70559 108 aa6.97□□□□□ -1.29
Nisch-222ENSMUST00000172142 Krtap4-7Q9D732 168 aa6.91□□□□□ -1.3
Nisch-222ENSMUST00000172142 Lce3eF8VQJ0 98 aa6.88□□□□□ -1.31
Nisch-222ENSMUST00000172142 Lce3fQ6PAI4 98 aa6.88□□□□□ -1.31
Nisch-222ENSMUST00000172142 Krtap31-1Q9D644 177 aa6.88□□□□□ -1.31
Nisch-222ENSMUST00000172142 Sprr2eO70556 76 aa6.85□□□□□ -1.31
Nisch-222ENSMUST00000172142 Lce1lQ9D1G7 135 aa6.82□□□□□ -1.32
Nisch-222ENSMUST00000172142 Lce3aQ497I5 98 aa6.78□□□□□ -1.32
Nisch-222ENSMUST00000172142 Sprr2fO70557 76 aa6.76□□□□□ -1.33
Nisch-222ENSMUST00000172142 Krtap6-3A0A087WQL6 57 aa6.65□□□□□ -1.34
Nisch-222ENSMUST00000172142 ObscnA2AAJ9 8891 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
Nisch-222ENSMUST00000172142 Lce1kJ3QP15 125 aa6.57□□□□□ -1.36
Nisch-222ENSMUST00000172142 Krtap4-16Q91W93 202 aa6.52□□□□□ -1.37
Nisch-222ENSMUST00000172142 Krtap20-2E9Q0A8 60 aa6.52□□□□□ -1.37
Nisch-222ENSMUST00000172142 Macf1Q9QXZ0 7354 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
Nisch-222ENSMUST00000172142 A0A1Y7VJH8 109 aa6.46□□□□□ -1.37
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm11568A2A4M2 211 aa6.32□□□□□ -1.4
Nisch-222ENSMUST00000172142 Krtap9-1Q64526 186 aa6.32□□□□□ -1.4
Nisch-222ENSMUST00000172142 Mt1P02802 61 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
Nisch-222ENSMUST00000172142 Krtap5-2Q9D5Z7 189 aa6.22□□□□□ -1.41
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm11554B1AQB2 190 aa5.96□□□□□ -1.46
Nisch-222ENSMUST00000172142 Hmcn1D3YXG0 5634 aa5.95□□□□□ -1.46
Nisch-222ENSMUST00000172142 Krtap31-2Q8CAY5 177 aa5.94□□□□□ -1.46
Nisch-222ENSMUST00000172142 Kmt2dQ6PDK2 5588 aa5.93□□□□□ -1.46
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm10024A0A0A0MQA4 119 aa5.93□□□□□ -1.46
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm11559Q9D3H7 191 aa5.9□□□□□ -1.46
Nisch-222ENSMUST00000172142 Muc16A0A140LJ72 8478 aa5.9□□□□□ -1.46
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm10153A0A1B0GRL1 320 aa5.83□□□□□ -1.48
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm4553A0A1B0GSA9 284 aa5.78□□□□□ -1.48
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm2431E9Q8S1 172 aa5.71□□□□□ -1.5
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm45337A0A1B0GS71 263 aa5.64□□□□□ -1.51
Nisch-222ENSMUST00000172142 Muc19Q6PZE0 7524 aa5.62□□□□□ -1.51
Nisch-222ENSMUST00000172142 Eppk1Q8R0W0 6548 aa5.57□□□□□ -1.52
Nisch-222ENSMUST00000172142 Mt3P28184 68 aa5.54□□□□□ -1.52
Nisch-222ENSMUST00000172142 DstQ91ZU6 7393 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
Nisch-222ENSMUST00000172142 A0A1Y7VLE6 161 aa5.48□□□□□ -1.53
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm40460A0A1B0GR10 244 aa5.42□□□□□ -1.54
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm7579A0A1B0GRJ4 243 aa5.42□□□□□ -1.54
Nisch-222ENSMUST00000172142 Krtap5-5Q2TA51 241 aa5.42□□□□□ -1.54
Nisch-222ENSMUST00000172142 Krtap5-4Q62220 223 aa5.42□□□□□ -1.54
Nisch-222ENSMUST00000172142 A030005L19RikA0A1Y7VIU2 113 aa5.36□□□□□ -1.55
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm11639A0A1D5RLM8 5808 aa5.33□□□□□ -1.56
Nisch-222ENSMUST00000172142 NebE9Q1W3 7152 aa5.19□□□□□ -1.58
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm39115A0A1B0GSH7 232 aa5.16□□□□□ -1.58
Nisch-222ENSMUST00000172142 1110025L11RikO09048 78 aa4.91□□□□□ -1.62
Nisch-222ENSMUST00000172142 Krtap6-5Q925H3 78 aa4.91□□□□□ -1.62
Nisch-222ENSMUST00000172142 AhnakE9Q616 5656 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gpr98Q8VHN7 6298 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
Nisch-222ENSMUST00000172142 Sprr2bO70554 98 aa4.65□□□□□ -1.67
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm45618A0A1B0GSA0 219 aa4.54□□□□□ -1.68
Nisch-222ENSMUST00000172142 A0A1Y7VJ07 166 aa4.48□□□□□ -1.69
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm10229O08631 77 aa4.33□□□□□ -1.72
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm11567Q9D141 195 aa4.16□□□□□ -1.74
Nisch-222ENSMUST00000172142 Phgr1Q8K0G7 91 aa4.1□□□□□ -1.75
Nisch-222ENSMUST00000172142 Krtap21-1Q925H4 128 aa4.03□□□□□ -1.76
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm29735A0A1B0GT06 219 aa4.02□□□□□ -1.77
Nisch-222ENSMUST00000172142 A0A286YCP9 139 aa3.93□□□□□ -1.78
Nisch-222ENSMUST00000172142 Krtap6-2O08884 159 aa3.59□□□□□ -1.83
Nisch-222ENSMUST00000172142 Krtap28-10A0A1Y7VP58 119 aa3.35□□□□□ -1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm7544A0A1Y7VJ58 118 aa3.2□□□□□ -1.9
Nisch-222ENSMUST00000172142 A030003K21RikA0A1Y7VIM3 128 aa3.19□□□□□ -1.9
Nisch-222ENSMUST00000172142 A030005K14RikA0A1Y7VNY1 122 aa3.09□□□□□ -1.91
Nisch-222ENSMUST00000172142 Krtap28-13A0A087WQP5 138 aa3.08□□□□□ -1.92
Nisch-222ENSMUST00000172142 Krtap5-1Q64507 230 aa2.84□□□□□ -1.95
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm6217A0A1Y7VJK9 128 aa2.74□□□□□ -1.97
Nisch-222ENSMUST00000172142 A030014E15RikA0A1Y7VJV2 120 aa2.58□□□□□ -2
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm4559A4IF42 199 aa2.36□□□□□ -2.03
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