RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 TFAP4Q01664 338 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 MAATS1Q7Z4T9 603 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 DRC1Q96MC2 740 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 RBSNQ9H1K0 784 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 CEP83Q9Y592 693 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 SLC1A4P43007 532 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 STX17P56962 302 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 AS3MTQ9HBK9 375 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 SWAP70Q9UH65 585 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 FSD2A1L4K1 749 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC24Q50LG9 513 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 CDAN1Q8IWY9 1227 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 LARGE2Q8N3Y3 721 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 CBX8Q9HC52 389 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 STX10O60499 249 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 FANCCQ00597 558 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 CEP128Q6ZU80 1094 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 CABP7Q86V35 215 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 KRT222Q8N1A0 295 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 TRIML1Q8N9V2 468 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 LRWD1Q9UFC0 647 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 PTPRMP28827 1452 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 APBA3O96018 575 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 TNFAIP1Q13829 316 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 SPECC1Q5M775 1068 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 NOSTRINQ8IVI9 506 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 MAGEF1Q9HAY2 307 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 MYO3AQ8NEV4 1616 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF804BA4D1E1 1349 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 MACROD2A1Z1Q3 448 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 IGSF22Q8N9C0 903 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 IFT74Q96LB3 600 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 GREM2Q9H772 168 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 USP40Q9NVE5 1235 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 DNM3Q9UQ16 869 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 hCG_1984214I3L0E3 225 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 TRAF5O00463 557 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 TNNC1P63316 161 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 MYSM1Q5VVJ2 828 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 SLFN12Q8IYM2 578 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 NLGN1Q8N2Q7 840 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 CHURC1Q8WUH1 139 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 PHKBQ93100 1093 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 PXDNLA1KZ92 1463 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 LAD1O00515 517 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 CBX1P83916 185 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 PROSER3Q2NL68 480 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 WDR44Q5JSH3 913 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC51Q96ER9 411 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC77Q9BR77 488 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 INCENPQ9NQS7 918 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 PODXL2Q9NZ53 605 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 TPCN1Q9ULQ1 816 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 CLEC11AQ9Y240 323 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 JAK2O60674 1132 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 BAG6P46379 1132 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 MFSD14BQ5SR56 506 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 SNX29Q8TEQ0 813 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 KIF20BQ96Q89 1820 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 KAT6BQ8WYB5 2073 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 CETN3O15182 167 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 TXKP42681 527 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 DLGAP5Q15398 846 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF569Q5MCW4 686 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 BLIDQ8IZY5 108 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 FANCBQ8NB91 859 aa7.23□□□□□ -1.25
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PDE4D-228ENST00000636120 TSNARE1Q96NA8 513 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 PTPRUQ92729 1446 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 ATP2A1O14983 1001 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 ASIC2Q16515 512 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 IKBKGQ9Y6K9 419 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 NRXN1Q9ULB1 1477 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 ARHGEF35A5YM69 484 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 FGAP02671 866 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 BCAMP50895 628 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 STRN3Q13033 797 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-228ENST00000636120 FAM196AQ6ZSG2 479 aa7.23□□□□□ -1.25
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