RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498007.1

HLA-B-255, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 1,087 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-255ENST00000498007 TATDN1Q6P1N9 297 aa23.64■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 BEGAINQ9BUH8 593 aa23.64■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 SWAP70Q9UH65 585 aa23.64■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa23.64■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 ZHX2Q9Y6X8 837 aa23.64■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 CHMLP26374 656 aa23.63■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 JAG1P78504 1218 aa23.63■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 BMP2KLQ5H9B9 411 aa23.63■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 WBP1LQ9NX94 342 aa23.63■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 ROBO3Q96MS0 1386 aa23.63■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa23.62■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 GH2P01242 217 aa23.62■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 ASNSP08243 561 aa23.62■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 GTF2A2P52657 109 aa23.62■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 CCL15Q16663 113 aa23.62■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 C16orf86Q6ZW13 317 aa23.62■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 IL25Q9H293 177 aa23.62■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 TRIM75PA6NK02 468 aa23.61■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 CDK8P49336 464 aa23.61■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 SNAPC2Q13487 334 aa23.61■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 ABCB5Q2M3G0 1257 aa23.61■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 MS4A4AQ96JQ5 239 aa23.61■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 PTPRFP10586 1907 aa23.61■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 RAD50Q92878 1312 aa23.6■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 USP17L5A8MUK1 530 aa23.6■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 PPARAQ07869 468 aa23.6■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 RUFY2Q8WXA3 655 aa23.6■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 BRI3BPQ8WY22 251 aa23.6■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 CETPP11597 493 aa23.59■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 TM4SF4P48230 202 aa23.59■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 RAB3GAP1Q15042 981 aa23.59■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 AS3MTQ9HBK9 375 aa23.59■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 CABP5Q9NP86 173 aa23.59■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 TSKSQ9UJT2 592 aa23.59■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 TAOK2Q9UL54 1235 aa23.59■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 KCNH4Q9UQ05 1017 aa23.59■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa23.59■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 LAMA4Q16363 1823 aa23.59■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP23.58■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 INHBEP58166 350 aa23.58■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 IFNL1Q8IU54 200 aa23.58■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 GINM1Q9NU53 330 aa23.58■■□□□ 1.37
HLA-B-255ENST00000498007 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 CXCL11O14625 94 aa23.57■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 FOXN1O15353 648 aa23.57■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 TRPA1O75762 1119 aa23.57■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 FGAP02671 866 aa23.57■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 AKR1B1P15121 316 aa23.57■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 CTDSPL2Q05D32 466 aa23.57■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 SPP2Q13103 211 aa23.57■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 ALX1Q15699 326 aa23.57■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF280CQ8ND82 737 aa23.57■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 MKNK2Q9HBH9 465 aa23.57■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 RNF186Q9NXI6 227 aa23.57■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 ZMYM6O95789 1325 aa23.57■■□□□ 1.36
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HLA-B-255ENST00000498007 PTPN18Q99952 460 aa23.56■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.56■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 LOC285556D6RIA3 1793 aa23.55■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 CA12O43570 354 aa23.55■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 HAND2P61296 217 aa23.55■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 SEPT2Q15019 361 aa23.55■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 GADL1Q6ZQY3 521 aa23.55■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF287Q9HBT7 754 aa23.55■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 SGSM2O43147 1006 aa23.54■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 RASA1P20936 1047 aa23.54■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 PDE4BQ07343 736 aa23.54■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 MTMR2Q13614 643 aa23.54■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa23.54■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 TMEM179Q6ZVK1 233 aa23.54■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.54■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 CCDC17Q96LX7 622 aa23.54■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 DSCC1Q9BVC3 393 aa23.54■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 SAGE1Q9NXZ1 904 aa23.54■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 BTBD19C9JJ37 291 aa23.53■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 GUCY1A2P33402 732 aa23.53■■□□□ 1.36
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HLA-B-255ENST00000498007 CLEC10AQ8IUN9 316 aa23.53■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 FEZ1Q99689 392 aa23.53■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 WDR18Q9BV38 432 aa23.53■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 CDC45O75419 566 aa23.52■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 ALDH1A1P00352 501 aa23.52■■□□□ 1.36
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HLA-B-255ENST00000498007 MOGSQ13724 837 aa23.52■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 ANAPC4Q9UJX5 808 aa23.52■■□□□ 1.36
HLA-B-255ENST00000498007 TBC1D8O95759 1140 aa23.51■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 ICA1Q05084 483 aa23.51■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 CASC1Q6TDU7 716 aa23.51■■□□□ 1.35
HLA-B-255ENST00000498007 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
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