RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496465.1

TM2D1-211, Transcript of TM2 domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TM2D1, Length 577 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D1-211ENST00000496465 ATP5JP18859 108 aa22.1■■□□□ 1.13
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TM2D1-211ENST00000496465 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.1■■□□□ 1.13
TM2D1-211ENST00000496465 RAET1EQ8TD07 263 aa22.1■■□□□ 1.13
TM2D1-211ENST00000496465 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
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TM2D1-211ENST00000496465 USP17L10C9JJH3 530 aa22.07■■□□□ 1.12
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TM2D1-211ENST00000496465 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.06■■□□□ 1.12
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TM2D1-211ENST00000496465 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
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TM2D1-211ENST00000496465 MTFR1Q15390 333 aa22.04■■□□□ 1.12
TM2D1-211ENST00000496465 DCTPP1Q9H773 170 aa22.04■■□□□ 1.12
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TM2D1-211ENST00000496465 SHMT1P34896 483 aa22.03■■□□□ 1.12
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TM2D1-211ENST00000496465 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
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TM2D1-211ENST00000496465 PXYLP1Q8TE99 480 aa22.03■■□□□ 1.12
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TM2D1-211ENST00000496465 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
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TM2D1-211ENST00000496465 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
TM2D1-211ENST00000496465 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.02■■□□□ 1.12
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TM2D1-211ENST00000496465 UBXN2AP68543 259 aa22.01■■□□□ 1.11
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TM2D1-211ENST00000496465 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.01■■□□□ 1.11
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TM2D1-211ENST00000496465 HERVK_113P62684 666 aa22■■□□□ 1.11
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TM2D1-211ENST00000496465 SLFNL1Q499Z3 407 aa22■■□□□ 1.11
TM2D1-211ENST00000496465 ARMT1Q9H993 441 aa22■■□□□ 1.11
TM2D1-211ENST00000496465 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22■■□□□ 1.11
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TM2D1-211ENST00000496465 GJB1P08034 283 aa21.99■■□□□ 1.11
TM2D1-211ENST00000496465 RAB3GAP1Q15042 981 aa21.99■■□□□ 1.11
TM2D1-211ENST00000496465 NKX2-3Q8TAU0 364 aa21.99■■□□□ 1.11
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TM2D1-211ENST00000496465 ELNP15502 786 aa21.98■■□□□ 1.11
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TM2D1-211ENST00000496465 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa21.97■■□□□ 1.11
TM2D1-211ENST00000496465 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
TM2D1-211ENST00000496465 FEZ1Q99689 392 aa21.97■■□□□ 1.11
TM2D1-211ENST00000496465 TXNRD2Q9NNW7 524 aa21.97■■□□□ 1.11
TM2D1-211ENST00000496465 RBPJLQ9UBG7 517 aa21.97■■□□□ 1.11
TM2D1-211ENST00000496465 GJD2Q9UKL4 321 aa21.97■■□□□ 1.11
TM2D1-211ENST00000496465 CHGBP05060 677 aa21.96■■□□□ 1.11
TM2D1-211ENST00000496465 INHAP05111 366 aa21.96■■□□□ 1.11
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