RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

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Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 EIF6P56537 245 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC178Q5BJE1 867 aa31.35■■■□□ 2.61
HOXB3-210ENST00000489475 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
HOXB3-210ENST00000489475 CLEC17AQ6ZS10 378 aa31.35■■■□□ 2.61
HOXB3-210ENST00000489475 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa31.35■■■□□ 2.61
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF654Q8IZM8 581 aa31.35■■■□□ 2.61
HOXB3-210ENST00000489475 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
HOXB3-210ENST00000489475 TMOD2Q9NZR1 351 aa31.35■■■□□ 2.61
HOXB3-210ENST00000489475 FAM198AQ9UFP1 575 aa31.35■■■□□ 2.61
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HOXB3-210ENST00000489475 PRELPP51888 382 aa31.34■■■□□ 2.61
HOXB3-210ENST00000489475 TCP10Q12799 353 aa31.34■■■□□ 2.61
HOXB3-210ENST00000489475 SERPINB13Q9UIV8 391 aa31.34■■■□□ 2.61
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HOXB3-210ENST00000489475 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa31.33■■■□□ 2.61
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HOXB3-210ENST00000489475 CDKL5O76039 1030 aa31.33■■■□□ 2.61
HOXB3-210ENST00000489475 RPS12P25398 132 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
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HOXB3-210ENST00000489475 CATIPQ7Z7H3 387 aa31.33■■■□□ 2.61
HOXB3-210ENST00000489475 SWAP70Q9UH65 585 aa31.33■■■□□ 2.61
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HOXB3-210ENST00000489475 FZD9O00144 591 aa31.32■■■□□ 2.6
HOXB3-210ENST00000489475 ADD1P35611 737 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
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HOXB3-210ENST00000489475 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa31.32■■■□□ 2.6
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HOXB3-210ENST00000489475 MTMR6Q9Y217 621 aa31.31■■■□□ 2.6
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa31.31■■■□□ 2.6
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HOXB3-210ENST00000489475 RTN1Q16799 776 aa31.31■■■□□ 2.6
HOXB3-210ENST00000489475 DGKHQ86XP1 1220 aa31.31■■■□□ 2.6
HOXB3-210ENST00000489475 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP31.31■■■□□ 2.6
HOXB3-210ENST00000489475 NUP133Q8WUM0 1156 aa31.31■■■□□ 2.6
HOXB3-210ENST00000489475 EHD4Q9H223 541 aa31.31■■■□□ 2.6
HOXB3-210ENST00000489475 BAG4O95429 457 aaKnown RBP31.3■■■□□ 2.6
HOXB3-210ENST00000489475 IL17RBQ9NRM6 502 aa31.3■■■□□ 2.6
HOXB3-210ENST00000489475 PPP2R5BQ15173 497 aa31.29■■■□□ 2.6
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HOXB3-210ENST00000489475 CALM3P0DP25 149 aa31.28■■■□□ 2.6
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HOXB3-210ENST00000489475 NEDD1Q8NHV4 660 aa31.28■■■□□ 2.6
HOXB3-210ENST00000489475 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP31.28■■■□□ 2.6
HOXB3-210ENST00000489475 PI4KBQ9UBF8 816 aa31.28■■■□□ 2.6
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP31.28■■■□□ 2.6
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HOXB3-210ENST00000489475 DDAH1O94760 285 aa31.28■■■□□ 2.6
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HOXB3-210ENST00000489475 CLRN2A0PK11 232 aa31.26■■■□□ 2.6
HOXB3-210ENST00000489475 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.6
HOXB3-210ENST00000489475 H3BQV1 296 aa31.26■■■□□ 2.6
HOXB3-210ENST00000489475 F13A1P00488 732 aa31.26■■■□□ 2.6
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HOXB3-210ENST00000489475 IFFO2Q5TF58 517 aa31.26■■■□□ 2.6
HOXB3-210ENST00000489475 KAT14Q9H8E8 782 aa31.26■■■□□ 2.6
HOXB3-210ENST00000489475 MYOZ2Q9NPC6 264 aa31.26■■■□□ 2.6
HOXB3-210ENST00000489475 GOLGA6L22H0YM25 854 aa31.26■■■□□ 2.59
HOXB3-210ENST00000489475 DPF2Q92785 391 aa31.26■■■□□ 2.59
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HOXB3-210ENST00000489475 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
HOXB3-210ENST00000489475 TCP10L2B9ZVM9 353 aa31.24■■■□□ 2.59
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HOXB3-210ENST00000489475 SHMT1P34896 483 aa31.24■■■□□ 2.59
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HOXB3-210ENST00000489475 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP31.24■■■□□ 2.59
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HOXB3-210ENST00000489475 ZNF541Q9H0D2 1346 aa31.22■■■□□ 2.59
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HOXB3-210ENST00000489475 SHTN1A0MZ66 631 aa31.21■■■□□ 2.59
HOXB3-210ENST00000489475 WNT10BO00744 389 aa31.21■■■□□ 2.59
HOXB3-210ENST00000489475 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
HOXB3-210ENST00000489475 MCTP1Q6DN14 999 aa31.21■■■□□ 2.59
HOXB3-210ENST00000489475 PNMA1Q8ND90 353 aa31.21■■■□□ 2.59
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