RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480416.1

TNS1-215, Transcript of tensin 1, human

TSL 2

Gene TNS1, Length 335 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNS1-215	ENST00000480416	MAP2K3	P46734	347 aa		4.41	□□□□□ -1.7
TNS1-215	ENST00000480416	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		4.41	□□□□□ -1.7
TNS1-215	ENST00000480416	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		4.41	□□□□□ -1.7
TNS1-215	ENST00000480416	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
TNS1-215	ENST00000480416	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		4.41	□□□□□ -1.7
TNS1-215	ENST00000480416	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
TNS1-215	ENST00000480416	RNF135	Q8IUD6	432 aa		4.41	□□□□□ -1.7
TNS1-215	ENST00000480416	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		4.41	□□□□□ -1.7
TNS1-215	ENST00000480416	MXD3	Q9BW11	206 aa		4.41	□□□□□ -1.7
TNS1-215	ENST00000480416	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	4.41	□□□□□ -1.7
TNS1-215	ENST00000480416	SNRK	Q9NRH2	765 aa		4.41	□□□□□ -1.7
TNS1-215	ENST00000480416	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
TNS1-215	ENST00000480416	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		4.41	□□□□□ -1.7
TNS1-215	ENST00000480416	CEP290	O15078	2479 aa		4.4	□□□□□ -1.7
TNS1-215	ENST00000480416	ALPK3	Q96L96	1907 aa		4.4	□□□□□ -1.7
TNS1-215	ENST00000480416	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		4.4	□□□□□ -1.7
TNS1-215	ENST00000480416	SCN9A	Q15858	1988 aa		4.4	□□□□□ -1.7
TNS1-215	ENST00000480416	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		4.4	□□□□□ -1.7
TNS1-215	ENST00000480416	NTSR2	O95665	410 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	BCR	P11274	1271 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	MX2	P20592	715 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	BMP8B	P34820	402 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	IRS1	P35568	1242 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	SCTR	P47872	440 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	GJA8	P48165	433 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	TCIRG1	Q13488	830 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	DBN1	Q16643	649 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	EFHC2	Q5JST6	749 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	WNK4	Q96J92	1243 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	COL4A1	P02462	1669 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	NUP98	P52948	1817 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	PIK3R2	O00459	728 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	BBOX1	O75936	387 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	CCL5	P13501	91 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	INHBE	P58166	350 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	GPSM2	P81274	684 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	CENPC	Q03188	943 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	SEMA3F	Q13275	785 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	GAS6	Q14393	721 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	TDH	Q8IZJ6	230 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	XAGE2	Q96GT9	111 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	GML	Q99445	158 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	NYX	Q9GZU5	481 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	RNF208	Q9H0X6	261 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	BTBD11	A6QL63	1104 aa		4.38	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	WNT10B	O00744	389 aa		4.38	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	SGPL1	O95470	568 aa		4.38	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	GJB1	P08034	283 aa		4.38	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	TEF	Q10587	303 aa		4.38	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		4.38	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		4.38	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		4.38	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		4.38	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		4.38	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	USP38	Q8NB14	1042 aa		4.38	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		4.38	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		4.38	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	WHAMM	Q8TF30	809 aa		4.38	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	MYLIP	Q8WY64	445 aa		4.38	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		4.38	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		4.38	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	SASH1	O94885	1247 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	IL2RA	P01589	272 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	GRAP	Q13588	217 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	TLR1	Q15399	786 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TNS1-215	ENST00000480416	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		4.37	□□□□□ -1.71

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