RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455157.6

SSUH2-208, Transcript of ssu-2 homolog (C. elegans), human

TSL 2

Gene SSUH2, Length 3,219 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSUH2-208	ENST00000455157	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	STX10	O60499	249 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	ERLIN1	O75477	346 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	WASF1	Q92558	559 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	12.87	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	ATF3	P18847	181 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	NR5A1	Q13285	461 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	SYNE4	Q8N205	404 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	MAP2K7	O14733	419 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	CASP1	P29466	404 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	KCNJ6	P48051	423 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	GRIN1	Q05586	938 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	12.86	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	RTN1	Q16799	776 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	RESP18	Q5W5W9	173 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	STRN4	Q9NRL3	753 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	KLHL33	A6NCF5	533 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	MLKL	Q8NB16	471 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	CASP7	P55210	303 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	N4BP3	O15049	544 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	USP8	P40818	1118 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	WTAP	Q15007	396 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	TEX33	O43247	280 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	MCAM	P43121	646 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	RABGGTA	Q92696	567 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	ARMT1	Q9H993	441 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	MBD4	O95243	580 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	GUCY1A2	P33402	732 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	INHBE	P58166	350 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	TC2N	Q8N9U0	490 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	MIEF2	Q96C03	454 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	TMEM87B	Q96K49	555 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	CTAGE9	A4FU28	777 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	ERLIN2	O94905	339 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	XBP1	P17861	261 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	ITGA6	P23229	1130 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	TXLNA	P40222	546 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	USP49	Q70CQ1	688 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	VPS16	Q9H269	839 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSUH2-208	ENST00000455157	LTN1	O94822	1766 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSUH2-208	ENST00000455157	PPFIA4	O75335	1185 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSUH2-208	ENST00000455157	MAP3K9	P80192	1104 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSUH2-208	ENST00000455157	RBL2	Q08999	1139 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSUH2-208	ENST00000455157	PTPA	Q15257	358 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSUH2-208	ENST00000455157	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
SSUH2-208	ENST00000455157	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSUH2-208	ENST00000455157	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSUH2-208	ENST00000455157	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSUH2-208	ENST00000455157	ABCF2	Q9UG63	623 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSUH2-208	ENST00000455157	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
SSUH2-208	ENST00000455157	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSUH2-208	ENST00000455157	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
SSUH2-208	ENST00000455157	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSUH2-208	ENST00000455157	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
SSUH2-208	ENST00000455157	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
SSUH2-208	ENST00000455157	FANCG	O15287	622 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSUH2-208	ENST00000455157	CIAO1	O76071	339 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSUH2-208	ENST00000455157	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSUH2-208	ENST00000455157	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
SSUH2-208	ENST00000455157	INTS13	Q9NVM9	706 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSUH2-208	ENST00000455157	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
SSUH2-208	ENST00000455157	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSUH2-208	ENST00000455157	HPSE	Q9Y251	543 aa		12.83	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.7 ms