RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRR20EP86478 221 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRR20CP86479 221 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRR20DP86480 221 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRR20BP86481 221 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRR20AP86496 221 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CRHR2Q13324 411 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRKG1Q13976 671 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF662Q6ZS27 426 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SP8Q8IXZ3 490 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SIX5Q8N196 739 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DEFB123Q8N688 67 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SH3TC2Q8TF17 1288 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC10A4Q96EP9 437 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ERO1AQ96HE7 468 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SSC5DA1L4H1 1573 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATP2B4P23634 1241 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RALBP1Q15311 655 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NBPF20Q3BBV1 942 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NAALADL2Q58DX5 795 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPEF2Q9C093 1822 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DLG5Q8TDM6 1919 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GNAT3A8MTJ3 354 aa7.22□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 VARSP26640 1264 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SEC13P55735 322 aa7.22□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 USP4Q13107 963 aa7.22□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MORC1Q86VD1 984 aa7.22□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF34Q8IZ26 560 aa7.22□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EHBP1Q8NDI1 1231 aa7.22□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SGSM3Q96HU1 749 aa7.22□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UBA5Q9GZZ9 404 aa7.22□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 POLLQ9UGP5 575 aa7.22□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ALDH1A1P00352 501 aa7.21□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 VIL1P09327 827 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MTFR1Q15390 333 aa7.21□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NBPF9Q3BBW0 867 aa7.21□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCDC102BQ68D86 513 aa7.21□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa7.21□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C1orf216Q8TAB5 229 aa7.21□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CLMNQ96JQ2 1002 aa7.21□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NLRP3Q96P20 1036 aa7.21□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa7.21□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MTMR10Q9NXD2 777 aa7.21□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 STAP2Q9UGK3 403 aa7.21□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CDH23Q9H251 3354 aa7.21□□□□□ -1.25
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 A0A1W2PPC1 479 aa7.2□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ERVV-1B6SEH8 477 aa7.2□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 VAMP1P23763 118 aa7.2□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GPSM2P81274 684 aa7.2□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SP3Q02447 781 aa7.2□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FOXC1Q12948 553 aa7.2□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TCIRG1Q13488 830 aa7.2□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GRAPQ13588 217 aa7.2□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 Q6ZNB5 142 aa7.2□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DPH6Q7L8W6 267 aa7.2□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CYP4X1Q8N118 509 aa7.2□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CNPY4Q8N129 248 aa7.2□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 WNK4Q96J92 1243 aa7.2□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PTPN18Q99952 460 aa7.2□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MYOZ2Q9NPC6 264 aa7.2□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa7.2□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MGAMO43451 1857 aa7.2□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SFI1A8K8P3 1242 aa7.2□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BBOX1O75936 387 aa7.2□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LDLRAD1Q5T700 205 aa7.2□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KIF6Q6ZMV9 814 aa7.2□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TPCN2Q8NHX9 752 aa7.2□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PANK3Q9H999 370 aa7.2□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SOWAHDA6NJG2 315 aa7.19□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRMT3O60678 531 aa7.19□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SASH1O94885 1247 aa7.19□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MYL6BP14649 208 aa7.19□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SCNN1AP37088 669 aa7.19□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SERPINB4P48594 390 aa7.19□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OCLNQ16625 522 aa7.19□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC10A5Q5PT55 438 aa7.19□□□□□ -1.26
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms